htseq-count [options] alignment_file gff_file -f 指定输入文件的格式,可以是 sam或 bam格式,默认是sam. -s 是否这个数据是来自链特异性建库(默认 yes) -a 指定一个最低 read mapping质量值,低于值会被过滤掉,默认是10 -t 指定最小计数单位类型,默认值是:exon -i GFF文件的一类属性,最终的计数单位,默...