2.bioconda安装HTSeq操作如下: 下载安装miniconda(即bioconda)。 添加channels 等等 (具体步骤参考本人的相关bioconda的博客) 安装HTSeq的命令如下: conda install HTSeq 输入上述命令,根据提示操作,可能有点慢。 安装完成后,测试一下HTSeq安装是否成功。 $python(HTSeq在Python中运行) >>>import HTSeq 上述操作Impor...
安装 $cdHTSeq-0.6.1p1/$python setup.py install --user 测试 $python>>> import HTSeq>>> 能够 完成在python 里面导入 HTSeq 这个包,说明安装成功。
conda create -n pyht conda activate pyht conda install htseq fastp hisat2 cd /work/home/acwnw4bl7y/HT22/HT22 export PATH=/work/home/acwnw4bl7y/sratoolkit.3.1.1-centos_linux64/bin/:$PATH source ~/miniconda3/bin/activate conda activate pyht ...
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tar -xzvf HTSeq-0.9.1.tar.gz## 解压cd HTSeq-0.9.1/python setup.py build python setup.py install--user## 安装cd~/.local/bin/## 进入软件可调用目录 003、测试命令 (base) root@DESKTOP-IDT9S0E:~/.local/bin#./htseq-countusage: htseq-count [options] alignment_file gff_file ...
解压 $ tar -zxvf HTSeq-0.6.1p1.tar.gz 安装 $cdHTSeq-0.6.1p1/$python setup.py install --user 测试 $python>>> import HTSeq>>> 能够 完成在python 里面导入 HTSeq 这个包,说明安装成功。