此外,我们在燕麦中发现了十对片段重复基因。物种间合成分析和同源基因鉴定表明,燕麦与其祖先物种共享大量同源基因;这意味着燕麦HSP90基因家族的扩张可能是通过燕麦多倍化和大片段重复而发生的。顺式作用元件分析揭示了它们在HSP90基因在非生物胁迫下的表达模式中的重要作用。在高温、盐、镉(Cd)、聚乙二醇(PEG)和脱落酸(ABA)胁迫下的燕麦基
中科院植物所舒庆艳团队结合基因组数据,共鉴定出149个HSP20家族成员,分为10个亚家族(图1),分布于5条染色体上。从花器官数量差异的两个材料的三个发育阶段的转录组中,共鉴定出38个差异表达的HSP20基因。根据差异表达情况和转录本中的SNP位点,从271个广泛栽培的牡丹品种进一步选择PoHSP89和PoHSP133进行克隆,通过序列...
MEME 分析结果表明,基序1、2、9是Hsp20共有的保守基序。转录组分析提示,15个Hsp 20的表达水平在干旱和(或)盐胁迫后出现了上调,该结果得到了qRT-PCR 实验的验证。以上结果为人们进一步探究Hsp 20基因的生物学功能提供了理论依据。关键词:拟南芥;热激蛋白20(Hsp20);基因家族;生物信息学分析;非生物胁迫;表达分析 ...
因为小分子热激蛋白的 分子量普遍在 20kDa 左右 , 故称为 HSP20 。 借助番茄基因组数据库 , 利用生物信息学方法对 HSP20 基因家族进行鉴定及分析 ,结 果表明 , 番茄中至少含有 43 个 HSP20 基因 , 不均匀的分布在番茄的 12 条染色体上 。 通过对茄科植物番茄 、 辣椒 、 马铃薯 HSP20 进 行系统进化...
一般来讲，植物抗逆强弱由自身携带的基因来决定。植物热激蛋白（ｈｅａｔｓｈｏｃｋｐｒｏｔｅｉｎ，ＨＳＰ）是在植物遭遇非生物胁迫时，激活并能大量产生的一类蛋白质；是广泛存在于各种生物体内、进化上高度保守的蛋白质［１］。根据分子量大小，热激蛋白可分为５个家族：即ｓＨＳＰ（小分子热激蛋白）、ＨＳＰ６０...
本研究在OssHSP基因外显子区域设计了带有PAM序列的靶位点,利用PCR扩增获得OssHSP基因sgRNA表达盒,成功构建了CRISPR/Cas9敲除载体;利用根癌农杆菌介导的遗传转化获得2个OssHSP基因(Os01g0136100和Os02g0782500)的T0代CRISPR转基因植株;通过PCR扩增和测序确定突变类型,获得48株不同突变类型的OssHSP1突变单株,6株不同...
1大鼠糖尿病性白内障晶状体组织中HSP27、MDR2mRNA和 MDR3mIⅢA的表达增强; 2全身应用儿茶素可降低血糖、减轻糖尿病性白内障大鼠晶状体混浊程 度,可以提高晶状体组织中HSP27、MDR2mRNA及MDR3mRNA表达; 3儿茶素对大鼠糖尿病性白内障具有一定的防治作用,作用机制与其降低 ...
1、通过HMM搜索然后确定包含ACD domain的序列,并且分子量在15–42kDa范围之内,鉴定到48个马铃薯Hsp20基因家族成员。 2、分析了Hsp20基因家族成员在进化上的关系,构建进化树时添加了水稻、大豆、水稻、杨树的Hsp20基因并且将StHsp20-29去掉(与其他序列的差异太大),进化树分成了12个亚族。
Hsp20(heat shock protein 20)基因家族在植物生长发育和胁迫响应中发挥着重要的作用。为探究大麻( Cannabis sativa L.) Hsp20 ( CsHsp20 )基因的功能,本研究在全基因组和转录组水平上采用生物信息学手段对 CsHsp20 基因家族进行系统性研究。结果表明,在大麻中鉴定到35个 CsHsp20 基因家族成员( CsHsp 20 -1...
摘要：热激蛋白Hsp90是广泛存在于微生物和动植物体中高度保守蛋白质之一，大量研究发现其参与生物 体应答应激反应、信号转导、细胞周期调控、蛋白降解及转运等生理活动，具有重要研究价值，因此在许多物 种中热激蛋白Hsp90基因家均被广泛关注和研究。但大豆中Hsp90基因家族详细信息尚不清楚，研究通过生物信 息学分析...