1、相对传统DIA的二级碎片离子定量,基于超高分辨一级全扫描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的数量和准确性都有显著提高(蛋白鉴定数目提高10%,CV<10%) 2、在HRMS1-DIA工作流正常运行的状态下,全部11个实验室,平均可以鉴定到超过8000个蛋白(1% protein FDR),定量超过6000个蛋白。 3、在定量准确性方面,在1小时定量6000...
HRMS1-DIA，1个cycle包括3个R120K MS1扫描，每个MS1扫描之间穿插18个15 Da 隔离窗口的R30K DIA MS / MS扫描（总共54个DIA MS/MS扫描）。高分辨的一级用于定量分析，二级用于肽段鉴定。此处采用的HRMS1-DIA方法中，MS1扫描周期速率（1.7s）与MS2循环时间无关，可确保有足够数量MS1扫描的数量保证定量的重现性。
作者首先建立了高通量、简化的HRMS1-DIA工作流程,该工作流程在随后的11个实验室中连续7天测试和集中的数据处理;开发了一种质量控制(QC)系统,以监视整个工作流程的性能,即时发现仪器性能的变化,并在必要时指导故障排除,确保维持较高水平的数据质量,以实现大型临床队列研究所需的通量;在整个研究过程中,每个实验室都使用...
1、相对传统DIA的二级碎片离子定量,基于超高分辨一级全扫描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的数量和准确性都有显著提高(蛋白鉴定数目提高10%,CV<10%) 2、在HRMS1-DIA工作流正常运行的状态下,全部11个实验室,平均可以鉴定到超过8000个蛋白(1% protein FDR),定量超过6000个蛋白。 3、在定量准确性方面,在1小时定量6000...
Orbitrap已经成为蛋白质组学实验室的金标准,赛默飞全球高级产品经理轩玥博士联合多个实验室瞄准数据非依赖性质谱采集(Data-independent acquisition,DIA)的非标记定量蛋白质组方法,用于支持精准医学的高通量临床蛋白质组学分析。作者首先建立了高通量、简化的HRMS1-DIA工作流程,该工作流程在随后的11个实验室中连续7天测试...
在HRMS1-DIA工作流正常运行的状态下,全部11个实验室,平均可以鉴定到超过8000个蛋白(1% protein FDR),定量超过6000个蛋白。 3 在定量准确性方面,在1小时定量6000个蛋白,50000个肽段的超高通量下,HRMS1-DIA工作流提供93%的定量准确性。 4 超高80%的蛋白可以在每天、每个实验室定量。
1、相对传统DIA的二级碎片离子定量,基于超高分辨一级全扫描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的数量和准确性都有显著提高(蛋白鉴定数目提高10%,CV<10%) 2、在HRMS1-DIA工作流正常运行的状态下,全部11个实验室,平均可以鉴定到超过8000个蛋白(1% protein FDR),定量超过6000个蛋白。 3、在定量准确性方面,在1小时定量6000...