最后,HRD评分系统确定后,还需要在中国人群中深入验证和进一步优化。 目前国内的普瑞基准正在率先研发HRD检测产品,其研发团队实力非常强大,有TCGA核心团队参与HRD评分算法的开发,这使得我们对普瑞基准的HRD检测模型充满信心。最重要的是普瑞基准开发的HRD评分,是基于中国人群数据,全面覆盖中国人群高多态性SNP位点,保证了对LO...
“为明确中国卵巢癌人群中真实的HRD状态,我们与普瑞基准联合启动了这项研究,旨在开发HRD评分(HRD score)模型进行HRD状态评估,并关联药物疗效研究,这对卵巢癌临床用药指导具有重要价值,可以补全临床对HRD评估的短板,让更多卵巢癌患者从
在泛癌种TCGA数据集中,TP53变异与更高的GI/HRD score相关,本研究进一步发现相较于TP53野生型和单等位基因变异,TP53双等位基因变异患者表现出显著增高的GI/HRD Score(图3);同时,在不同的突变类型和外显子中,TP53单等位基因失活和双等位基因失活的百分比不同(图3)。这些数据表明,TP53双等位基因失活与高GI/HRD ...
“为明确中国卵巢癌人群中真实的HRD状态,我们与普瑞基准联合启动了这项研究,旨在开发HRD评分(HRD score)模型进行HRD状态评估,并关联药物疗效研究,这对卵巢癌临床用药指导具有重要价值,可以补全临床对HRD评估的短板,让更多卵巢癌患者从
目前国内的普瑞基准正在率先研发HRD检测产品,其研发团队实力非常强大,有TCGA核心团队参与HRD评分算法的开发,这使得我们对普瑞基准的HRD检测模型充满信心。最重要的是普瑞基准开发的HRD评分,是基于中国人群数据,全面覆盖中国人群高多态性SNP位点,保...
数据TCGA-BRCA:SNP arry、RNA-seqGEO:E-MTAB-365, GSE19615, GSE21653, GSE2603,GSE31519,GSE118389(TNBC Single-cell RNA-seq),GSE124821(TNBC),Imvigor210(膀胱癌)结果:一、HRD亚型分析:1)HRDscore亚型划分(HRD score前20%和后20%样本);2)亚型间基因组不稳定性signature差异(子图A-C(TMB、MSI、FGA);...
目前国内的普瑞基准正在率先研发HRD检测产品,其研发团队实力非常强大,有TCGA核心团队参与HRD评分算法的开发,这使得我们对普瑞基准的HRD检测模型充满信心。最重要的是普瑞基准开发的HRD评分,是基于中国人群数据,全面覆盖中国人群高多态性SNP位点,保证了对LOH、TAI、LST的精准计算,也就是保证了HRD评分的准确性,这对于后续指...
For TCGA tumors without underlying HR pathway mutations, the median HRD score was 11, significantly lower than ovarian carcinoma lacking BRCA1/2 mutations (median = 28). In the absence of HR gene mutations, the median HRD score was unexpectedly higher among prostate cancers with TP53 mutations ...
季序我博士表达了对该项目的期许,希望通过该项目,形成中国卵巢癌HRD状态最权威的数据库,并建立适用于中国患者人群的HRD score模型,进而探索HRD与PARP抑制剂的疗效关联性。普瑞基准作为国内领先的肿瘤转化医学公司,秉持“数据驱动研发”的理念,基于自身在生物信息、多组学、生物统计方面的独特技术优势,为医疗机构、临床专家...
结合HRD- loh 、LST和NtAI的得分即为HRDscore,不同癌症类型的HRD评分差异很大,最高的是OV,最低的是KICH、KIRP)、LAML和THCA。许多癌症类型也有小的样本亚群具有高的HRD得分。在八种癌症类型中,HRD评分与PFI显著相关。HRD显著正相关的HR通路基因包括BRCA1、BRCA2、RAD51B和RAD51C。BRCA1变化在预测高HRD得分...