常用这个网站进行免疫组化结果的查找以及基因在不同细胞系表达量的查询,功能强大的网站,科研人必备,摸索阶段哈哈哈哈,新up主,希望大家可以多多支持一下哈哈哈哈, 视频播放量 2207、弹幕量 1、点赞数 62、投硬币枚数 34、收藏人数 167、转发人数 22, 视频作者 科研倩倩,
且看HPA数据库(Human Protein Atlas),人蛋白质图谱。 https://www./ 02 NA表示这方面没有数据。 03 组织 可以看到,这个基因在呼吸系统有RNA表达,在大脑最多;蛋白质无相关数据。 还有不同的展示方式。 另外一个数据库的数据! 04 单细胞 点击单细胞! 该基因在不同细胞中的表达情况。 在支气管不同细胞中的表...
全脑切片的免疫荧光,可放大看到每一个细胞 血液图谱 我们以白细胞标志物CD45为例,现在名为PTPRC 同样是基本信息,其中在所有血细胞(此处不包括红细胞)均检出与我们的背景知识相符。 可以看到血液图谱目前仅有RNA信息,没有蛋白信息。 不同数据集中表达情况,可以发现该基因在所有白细胞中均表达。 其余三类信息待补充。
进入HPA数据库,搜索检索词:PDCD1,在结果检索界面选择“Blood”。在该界面上,我们可以看到PDCD1的一般信息,以及人类蛋白表达图谱信息。我们发现PDCD1预测的部分主要为细胞内和细胞膜,在蛋白谱里可以看到该基因在哪个细胞系上富集。 继续下拉,我们可以看到在三个数据库中相关信息,分别是Consenses dataset,Monaco scaled ...
1在搜索栏输入基因名称。点击search。 2搜索结果如下:首先是对PTEN基因的描述:致癌基因、肿瘤相关基因,然后是pten在组织,细胞,肿瘤中表达。 3点击组织栏,查看pten在人体各组织表达情况,又可分为RNA 表达以及蛋白表达。 4点击人体组织表达图谱右侧组织名称,比如睾丸,可以查看组织免疫组化图。在网页的左侧显示标本信息...
•更方便的查询实验数据:每一支金标抗体实验验证结果都可以在the Human Protein Atlas (proteinatlas.org) 网站上免费公开查询,包括免疫组化,WB和免疫荧光的图片数据。 HPA金标抗体应用举例 下图为抑癌基因ARID1A (抗体货号:HPA005456)在不同组织和细胞系中的表达和分布,更多检测数据请登录http://www.proteinatlas...
1在搜索栏输入基因名称。点击search。 2搜索结果如下:首先是对PTEN基因的描述:致癌基因、肿瘤相关基因,然后是pten在组织,细胞,肿瘤中表达。 3点击组织栏,查看pten在人体各组织表达情况,又可分为RNA 表达以及蛋白表达。 4点击人体组织表达图谱右侧组织名称,比如睾丸,...
The Cell Line section,展示蛋白编码基因在人类细胞系中的表达情况; The Structure section,展示实验得到的和预测的蛋白质三维结构,包括抗原表位和变异位点; The Interaction section,,探索在蛋白-蛋白和代谢相互作用网络的环境中,蛋白编码基因的表达和特征;
Human Protein Atlas(简称HPA)数据库(https://www.proteinatlas.org/),2003年由瑞典 Knut & Alice Wallenberg基金会创建,它致力于提供全部24000多种人类蛋白质的组织和细胞分布信息,检查每一种蛋白质在多种人类正常组织、肿瘤组织、细胞系和血液细胞内的分布和表达情况,其结果用免疫组化染色图表示,并有专业人员标引...
“SUBCELL”栏,存在General information,Human protein atlas information,Single cell types以及Single cell tissue。在这个专栏里我们能看到该蛋白在细胞中的表达位置。 我们可以查阅基因/蛋白在不同系统中细胞系中表达情况(后面也有Cell line专栏)。 Subcell能够告诉我们基因表达的空间位置以及表达强度。