从HPA数据库中获取到免疫组化结果: 进入HPA数据库(https://www.proteinatlas.org/)→输入基因名称(NDUFAF6)→点击“Search” →选择“Tissue“→选择”breast“→挑选正常组织免疫组化图片→回到第二张图的界面选择”Pathology“→选择”breast cancer“→挑选病理组织免疫组化图片。 03.论文使用HPA图片的文字表述 ...
HPA由12个独立的部分组成 Tissue ,展示蛋白质在人体主要组织和器官中的分布; 主要是mRNA和蛋白质水平的表达谱。44种正常人体组织的蛋白质表达数据来源于基于抗体的免疫组化分析。所有正常组织的IHC图像和蛋白表达水平注释一起使用。蛋白质数据涵盖15303个基因(76%),其中有可用的抗体。mRNA表达数据来源于基因的深度测序...
HPA数据库的背景可追溯到2003年，由瑞典科学家与Knut & Alice Wallenberg共同推动的人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas）计划创建。经过持续的更新与改进，HPA数据库的内容日益丰富。在2019年，该数据库进一步扩展了其涵盖范围，并持续更新至2020年3月6日的v19.3版本。这一版本不仅包含了组织图谱、细胞图谱、病理图谱...
HPA数据库是由世界各地的科学家合作,旨在构建一个全面的人类蛋白质组织定位和表达信息数据库。该数据库的建立主要基于大规模的免疫组化实验数据,结合生物信息学方法,对人体各个组织和器官中的蛋白质表达进行了系统的研究和分析。 二、数据库功能 1.蛋白质组织定位信息查询 HPA数据库提供了详细的蛋白质在人体各个组织和...
Human Protein Atlas 数据库,简称HPA数据库,它致力于提供全部24,000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息,并免费提供公众查询。 创立这个数据库的瑞典 Knut & Alice Wallenberg基金会使用特制的抗体,用免疫组化的技术,检查每一种蛋白质在48种人类正常组织,20种肿瘤组织,...
HPA数据库网站列出了蛋白抗体的详细信息,包括供应商(Sigma-Aldrich)、来源物种(兔/鼠)、单/多抗、纯化方法等。提供了每种抗体已有的具体实验结果,包括免疫荧光、免疫组化和WB等,这些信息可为大家选择抗体提供指导。提供了细胞尺度下的蛋白表达情况,其中比较关键的信息是蛋白在不同细胞类群、以及同一细胞内的空间分布...
比如说,我们身体里有各种各样的细胞,每个细胞里又有很多不同功能的蛋白质,hpa数据库就像是一个放大镜,能让我们看清楚这些蛋白质都分布在细胞的哪个角落,是在细胞核里呢,还是在细胞质里。这对我们了解人体的生理机能可是有着巨大的意义。那怎么去研究这个宝藏数据库呢?这就涉及到下面要讲的研究方法啦。 二、...
HPA是一个集 组织图谱、细胞图谱、病理图谱、大脑图谱、血液图谱、代谢图谱 为一体的数据资源,小编不允许你错过这个资源宝库! HPA数据库介绍 Human Protein Atlas 数据库,目前收录了超过26000种抗体,所有结果均有免疫组化染色,并经过专业人员的确认。准确度高,可信度强,而且还免费,是数据挖掘的必备神器。
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HPA 规则表数据库设计主要包括以下几个方面: 1.规则表结构设计:根据业务需求,设计合理的规则表结构,包括字段名称、数据类型、主键及外键设置等。 2.规则表数据存储设计:选择合适的存储方式,如关系型数据库、NoSQL 数据库等,以满足规则表数据的存储需求。 3.规则表数据管理设计:设计合理的数据管理策略,包括数据增、...