上期,小编已经给大家介绍了代谢组学常用数据库之-KEGG,本期将着重介绍一下HMDB(Human Metabolome Database,人类代谢组学数据库)。 人类代谢组数据库(www.hmdb.ca)是一个基于Web的代谢组学数据库,其中包含有关人类代谢物及其生物学作用,生理浓度,疾病关联,化学反应,代谢途径和参考光谱的全面信息。 2007年,HMDB被认...
MetaboAnalyst:物质名称/HMDB/KEGG等ID批量转换,保姆级教程,看了必会,欢迎大家交流学习!!!, 视频播放量 4613、弹幕量 83、点赞数 82、投硬币枚数 51、收藏人数 248、转发人数 33, 视频作者 科研划水大师, 作者简介 分享一些科研经验;专注组学,机器学习和数据分析;
每个代谢物条目里包含物质的分子量、结构、分子式、分类、生物学作用、生理浓度、组织位置、疾病和遗传关联、化学和酶促反应、代谢途径和参考图谱等信息。还有超链接能够连接到其它数据库,包括KEGG、PubChem、MetaCyc和ChEBI等。 为了满足代谢组学研究中不断变化的需求,自2007年首次发布以来,HMDB一直在快速地扩大和更新...
上期,小编已经给大家介绍了代谢组学常用数据库之-KEGG,本期将着重介绍一下HMDB(Human Metabolome Database,人类代谢组学数据库)。 人类代谢组数据库(www.hmdb.ca)是一个基于Web的代谢组学数据库,其中包含有关人类代谢物及其生物学作用,生理浓度,疾病关联,化学反应,代谢途径和参考光谱的全面信息。 2007年,HMDB被认...
粪便代谢物数据库包含有关人类粪便中发现的许多小分子代谢物和许多浓度值的详细信息。每个代谢物条目都包含110多个数据字段,其中许多都超链接到其他数据库(KEGG,PubChem,ChEBI,Chemspider,DrugBank,PDB和Uniprot)。该信息包括文献资料和实验得出的化学数据,临床数据和分子/生物化学数据。
每个代谢物条目里包含物质的分子量、结构、分子式、分类、生物学作用、生理浓度、组织位置、疾病和遗传关联、化学和酶促反应、代谢途径和参考图谱等信息。还有超链接能够连接到其它数据库,包括KEGG、PubChem、MetaCyc和ChEBI等。 为了满足代谢组学研究中不断变化的需求,自2007年首次发布以来,HMDB一直在快速地扩大和更新...
每个代谢物条目里包含物质的分子量、结构、分子式、分类、生物学作用、生理浓度、组织位置、疾病和遗传关联、化学和酶促反应、代谢途径和参考图谱等信息。还有超链接能够连接到其它数据库,包括KEGG、PubChem、MetaCyc和ChEBI等。 为了满足代谢组学研究中不断变化的需求,自2007年首次发布以来,HMDB一直在快速地扩大和更新...
虽然KEGG,Reactome和Cyc数据库等存在许多“代谢”数据库,但真正的“代谢组学”数据库相对较少。一些较为知名的代谢组学数据库包括Metlin,MetaboLights, Metabolomics Workbench,Lipid Maps和HMDB。 三大功能PLUS解读 Treasure in the heart 01 HMDB现有数据的扩展和增强...
粪便代谢物数据库包含有关人类粪便中发现的许多小分子代谢物和许多浓度值的详细信息。每个代谢物条目都包含110多个数据字段,其中许多都超链接到其他数据库(KEGG,PubChem,ChEBI,Chemspider,DrugBank,PDB和Uniprot)。该信息包括文献资料和实验得出的化学数据,临床数据和分子/生物化学数据。
In the 2009 release of HMDB, we described the addition of 30 new pathway diagrams to the database which supplemented a number of KEGG pathway diagrams. Since then, these early pathway diagrams have been sub- stantially upgraded in terms of quality, quantity and viewability, particular...