Human Metabolome Database(HMDB)是一个专注于人类代谢组学的综合数据库,提供代谢物的化学、生物化学及生理学数据
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Sequence Search:允许用户对HMDB中包含的5,702个基因和蛋白质序列进行BLAST序列搜索。支持单序列和多序列查询。 Advanced Search:用户可以选择或搜索子字段的各种组合。高级搜索是易于使用的关系查询搜索工具, MS Search:允许用户提交质谱文件(MoverZ格式),将根据HMDB的LC-MS / MS谱库进行搜索,这样可以通过LC-MS / MS...
HMDB数据库,全称Human Metabolome Database,是一个提供详细信息的人体代谢物数据库。这个数据库包括两个主要部分:自然代谢物和药物代谢物。自然代谢物部分包括了在健康人体内发现的所有代谢物,而药物代谢物部分则包括了所有已知药物的代谢物。HMDB数据库包含了大量的化学、临床和生物学数据,这些数据可以用于生物化学、医学...
结果表明,CFM-ID 4.0能同时预测 QTOF质谱正离子模式和负离子模式在在HMDB 5.0版本的217920 种代谢产物 ,在三种不同的碰撞能量(10,20和40 eV),这导致生成1 440 324个MS/MS谱 (HMDB 5.0中每个代谢物条目对应6个谱),有数百万个预测片段标签——所有这些都已在每个HMDB中呈现为交互式显示JSV开发的MetaboCard中。
人类代谢数据库(HMDB,https://hmdb.ca)是最大、最全面的生物体特异性代谢数据库。该数据库包含或链接了三种数据:化学数据、临床数据和分子生物学/生物化学数据。目前,该数据库包含220945个代谢物条目,包括水溶性和脂溶性代谢物。此外,还包含了8610个和这些代谢条目有关的蛋白质序列(酶和转运蛋白)。
HMDB (人类代谢组数据库)收录了很多代谢组的数据,用于代谢组学、临床化学、生物标志物开啊和基本教育等。数据联通化学、临床、分子生物学3个层次,共有114,099个代谢物。 网站提供了多种浏览和查询功能,可以关注不同的疾病、通路、BMI、年龄、性别相关代谢组学。
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在迈维代谢交付的代谢组学数据中,物质会对应有“HMDB”一列信息,该内容即为各物质在HMDB数据库中对应的编号,我们可以通过将该编号复制到HMDB数据库文本搜索框内进行查询。 以“HMDB0000123”为例,检索结果如下: (1)首先可以获取代谢物的基本定性信息,包含名...