另外第二代测序可以直接获得唯一的等位基因分型结果,解决了SBT分型中模棱两可的分型结果,也有利于新HLA等位基因的发现。虽然目前第二代测序技术并不是主流的HLA分型技术,但是随着技术的进一步发展及成本的降低,其临床应用也会更加普遍。