www.nature.com/scientificreports OPEN The Associations of HLA-A*02:01 and DRB1*11:01 with Hepatitis C Virus Spontaneous Clearance received: 05 March 2016 Are Independent of IL28B in theaccepted:20July2016 Chinese PopulationPublished:11August2016 Jieting Huang1,2,*, Ke Huang1,2,*, Ru...
SNPBPAssociated GeneA1MAFCOPDMAFControlsp ValueOR (95% CI) rs72881217 33119305 Intergenic T 0.17 0.09 9.43 × 10−4 2.06 (1.33–3.18) rs535586 31860337 EHMT2 (Synonymous Variant) A 0.11 0.19 1.04 × 10−3 0.52 (0.35–0.77) rs75456009 31321551 HLA-B (Downstream Variant) G 0.31 0.21 ...
2.4 利用PacBio数据组装MHC区域以及SNP在MHC区域上的分布MHC捕获探针设计区域大小为4 970 458 bp (Chr.6:28 477 797~33 448 354 bp),使用FALCON软件对YH标准细胞系进行组装,得到的最佳组装结果为:MHC组装大小为4.46 Mb,Contig N50为85 kb,Contig总数154个。将组装的Contig比对到YH基因组的参考序列上(图3),可...
直接进行HLA‑B*58:01基因检测的方法相较于SNP连锁位点的更加准确、可靠。 [0014]目前可查的直接检测HLA‑B*58:01基因的专利多使用PCR‑SSP法(CN103805701A、CN103484533A、CN104017898)或多探针Taqman法(CN105950766B、CN109517891A、CN108624676A),但基于这些方法开发的试剂成本高,操作复杂,且检测的模板只能...
Figure 1. (A) FVIII 野生型肽的结合评分。表 1 中以粗体显示的合成野生型肽在 REVEAL 检测中的结合评分是测量的。每行代表一个肽,每列代表一个 MHC-II 等位基因。这些肽基于 FVIII 基因中 H2 至 H6 单倍型出现的位置分组在一起。在每个 ns-SNP 的位置周围使用重叠肽。阳性对照 (PC) 肽是 FVIII 的已知...
hung等人(pnas,102(11)4134-4139(2015))对台湾地区发生的51例别嘌呤醇所致严重皮肤不良反应的患者和228例别嘌呤醇耐受者的研究中,发现与重症药疹呈强相关的snp位点都位于mhc基因上,集中在hla-a,b,c和drb1基因座,尤其是hla-b*58:01等位基因。hla-b*58:01在服用别嘌呤醇后出现严重皮肤不良反应的患者中100%...
The human leukocyte antigen (HLA) haplotype DRB1*15:01 is the major risk factor for multiple sclerosis (MS). Here, we find that DRB1*15:01 is hypomethylated and predominantly expressed in monocytes among carriers of DRB1*15:01. A differentially methylate
HLA-B*57:01与阿巴卡韦超敏反应——2012nature 5 整理课件ppt HLA与药物超敏反应 HLA-B*13:01与氨苯砜超敏综合征 ——2013TheNewEnglandJournalofMedicine 6 整理课件ppt 全基因关联分析（GWAS）在人类全基因组范围内找出存在的序列变异，即单核苷酸多态性（SNP），从中筛选出与疾病相关的SNPs。患者全基因组...
与SEQ ID NO.9或/和SEQ ID NO.10所示的核苷酸序列为一组的SEQ ID NO.11和SEQID NO.12所示的核苷酸序列。 5.一种检测HLA-B5801基因的SNP基因芯片,其特征在于,所述芯片以HLA基因的rs9263726或/和rs3099844或/和rs2734583为检测位点对应的如SEQ ID NO.1-4,SEQ IDNO.5-8,SEQ ID NO.9-12所示的Taqman...
Genome-wide DNA methylation profiles were compared between 31 patients with DHS and 31 dapsone-tolerant control subjects (all carrying HLA-B∗13:01) from the discovery set. A total of 759,996 CpG sites were identified by the Infinium Methylation 850k BeadChip, in which 11,181 CpG sites rea...