更大的差异是,精英控制者体内完整的HIV-1序列往往插在不编码的内含子中,或者插入的方向与宿主基因序列相反。这显然也严重地抑制了HIV-1序列的活性。 其中还有个值得一提的基因叫KRAB-ZNF,在精英控制者体内,完整HIV-1序列插入到这个...
更大的差异是,精英控制者体内完整的HIV-1序列往往插在不编码的内含子中,或者插入的方向与宿主基因序列相反。这显然也严重地抑制了HIV-1序列的活性。 其中还有个值得一提的基因叫KRAB-ZNF,在精英控制者体内,完整HIV-1序列插入到这个基因中的比较多:在18个有完整的前病毒序列的基因中,KRAB-ZNF中包括33%的完整前...
近日,中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心和河北医科大学公共卫生学院的研究人员 利用二代测序技术,成功建立了一种适合我国主要流行亚型的HIV-1近全长基因组扩增和测序方法,并优化建立标准检测流程,其中测序数据使用病原微生物信息分析系统(北京微未来公司)进行自动整理、拼接和分析。这为为HIV-1的全基因组序列...
方法:应用巢式逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)方法,分段扩增HIV一1近全长基因组相应片段,进行克 隆、测序.并分析其遗传进化树和序列断点位置。结果:近全长序列分析提示,该患者所感染的病毒由CRF01一AE和 HIV一1B’亚型嵌合组成,两者各占约5O%:其多聚酶蛋白基因(P0f)和外膜糖蛋白基因(Env)区均有HIV.1B’...
使用PCR技术对14份广西HIV-1阳性感染者外周血单核细胞(PBMCs)样品进行扩增,获得HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2-V3及邻区350~450个核苷酸序列进行了测定和分析.结果表明,14份样品中9份为泰国B(B')亚型,5份为E亚型毒株.其中B'亚型毒株的基因离散率为4.2%,与A-E参考亚型及部分B亚型代表株序列相比...
目的了解广东省女性吸毒者中艾滋病病毒1型(HIV1)亚型的流行规律及其与国际参考株的同源性。方法应用套式聚合酶链反应对20例广东省感染了HIV1的女性吸毒者淋巴细胞富集液的核酸样品进行扩增,并使用ABI377型测序仪对扩增产物测序后,对其env基因C～V段的核酸序列进行比较分析。结果20份血样中,9份为07BC重组亚型,与国...
我国首次发现的HIV-1和HIV-2双重感染样品中病毒部分基因的序列特征分析邢辉1,潘品良1,冯毅1,林旭东1,于健石1,龚新昌1,戴玉琳2,邵一鸣1(1.卫生部艾滋病预防与控制中心参比室,北京100050;2.上海市卫生检疫局,上海200335)摘要:上海市卫生检疫局送检了一例HIV-1和HIV-2抗体检测均呈阳性的双重感染样品,对其感染的...
福建省分离的HIV-1 Thai-B亚型感染性克隆的构建及序列分析
深圳地区HIV-1流行毒株的env基 因序列测定和亚型分析 【摘要】目的了解深圳地区HIV-1各亚型毒株的流行情况和传播方 式。方法用套式-聚合酶链反应(nested-PCR)对5份在深圳市发现的HIV-1感 染者外周血单个核细胞(PBMC)中的HIV-1膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及 其邻区350-450个核苷酸序列进行测定和分析。结果...
分离我国流行的HIV毒株并进行相关基因序列特征的分析是建立我国HIV毒种库,认识我国HIV的生物学特征,分析其流行和变异重组规律的重要基础;全基因组的序列测定有助于阐明毒株的进化特征,可以为有关病毒流行特征等方面的研究提供一个完整,清楚的遗传学和分子生物学背景.本研究首先对我国部分地区流行的HIV-1毒株进行分离培养...