HIVdb - HIV药物抗性数据库（HIV Drug Resistance Database），是由斯坦福大学维护的一个用于预测HIV对抗逆转录病毒药物敏感性的数据库。WHO - 世界卫生组织（World Health Organization），是联合国下属的一个专门机构，负责全球公共卫生事务。SAS - 一种统计分析软件（Statistical Analysis System），用于数据分析和...
分别使用Stanford HIV数据库算法和HIV-TRACE,对HIV-1 pol序列进行PDR和遗传网络分析。采用单变量和多变量逻辑回归模型,探讨与PDR相关的潜在因素。 共纳入3236名HIV阳性个体。PDR的总流行率为6.0%(194/3236)。NNRTI的PDR频率(3.3%)远高于NRTI(1.7%,p<0.001)和PI(1.2%,p<0.001)。 多变量逻辑回归分析显示,18～29...
URF - 独特重组形式(Unique Recombinant Form),指的是在HIV病毒基因组中发现的独特重组事件。 HIVdb - HIV药物抗性数据库(HIV Drug Resistance Database),是由斯坦福大学维护的一个用于预测HIV对抗逆转录病毒药物敏感性的数据库。 WHO - 世界卫生组织(World Health Organization),是联合国下属的一个专门机构,负责全...
1.2.3 耐药判定 将序列提交至斯坦福耐药数据库(Stanford HIV Drug Resistance Database, http://hivdb.Stanford.edu), 通过在线分析工具对耐药突变位点(drug resistance mutations, DRMs)鉴定和解释, 得到所有抗病毒治疗药物的耐药程度以及耐药突变位点情况。根据耐药评分将药物敏感性分为五个水平:敏感(0~9)、潜在耐...
Using apublic data set of matched genotypephenotype pairs for subtype Bsequences ffrom the Stanford HIV Drug Database (Kantor et al.2001)], estimated fitness was compared to in vitro resistance fold changephenotype. Sequences with unknown amino acid mutations ('Z’or '’)were removed, as wer...
ART - 抗逆转录病毒治疗(Antiretroviral Therapy),是用于治疗HIV感染的药物治疗方案。 TDR - 传播性药物抗性(Transmitted Drug Resistance),指的是HIV病毒对某些抗逆转录病毒药物的抗性,这种抗性可以在病毒传播时被传递给新的宿主。 NNRTI - 非核苷类逆转录酶抑制剂(Non-Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitor),是...
Pleuni S.Department of BiologyStanford UniversityInfectious Disease ReportsPennings PS. HIV Drug resistance: problems and per- spectives. Infect Dis Rep. 2013;5:e5.Pennings, P. S. (2013). HIV drug resistance: problems and perspectives. Infect Dis Rep 5 (Suppl 1), e5....
Additionally, the studies utilized genotyping methods for evaluating HIVDR and employed the Stanford HIV Drug Resistance Database (http://hivdb.stanford.edu) for resistance assessment. Exclusion criteria comprised studies using data from gene banks or relying on information from medical records of ...
供给HIV-1耐药基因型检测数据分析和解释系统(HIVDRDB)的主要机构有:国际艾滋病协会(IAS,://iasusa.org),美国斯坦福大学(HIVDB,://hivdb.stanford.edu),法国国家艾滋病争论署(ANRS,“://hivfrenchresistance.org/index.htm)和比利时“://hivfrenchresistance.org/index.htm)和比利时Leuven大学Rega医学争论所(REGA...
1、HIV-1耐药检测技术标准 1范围本章规定了 HIV-1耐药基因型检测的实验室条件、方法、结果判定及质量限制,适用于血浆、血清和滤纸干血斑样品的HIV- 1耐药基因型测定.2标准性弓I用文件Antiretroviral drug resistance testing in adultHIV-1 infection: 2021 recommendations of anInternational AIDS Society-USA pane...