1、安装,官网下载源代码包hifiasm官网,目前用的新版本,v0.16.0 cd hifiasm && make #hifiasm安装非常简单,只需要到代码包里make就好 2、常用参数,hifiasm常用参数有-l和-n参数, -l:0-没有对组装去冗余,组装结果包括全部组装出来的contig,可能包含多个单倍体基因组;2/3,会对组装出来的基因组进行去冗余,对于二...
一、安装 gitclonehttps://github.com/chhylp123/hifiasmcdhifiasm && make 二、测试 wget https://github.com/chhylp123/hifiasm/releases/download/v0.7/chr11-2M.fa.gz ./hifiasm -otest-t4 -f0 chr11-2M.fa.gz 2> test.log awk'/^S/{print ">"$2;print $3}'test.bp.p_ctg.gfa > test.p...