2.基因集变异分析(GSVA)和无监督聚类分析: 采用基因集变异分析(GSVA)获得绝对富集评分,计算PCa样本中HIF-1信号通路富集。首先,从KEGG数据集下载HIF-1信号通路的基因集(hsa04066)。然后,利用GSVA分析不同PCa样本中基于HIF-1信号通路的富集评分。基于HIF-1信号通路的富集分数对PCa样本进行层次聚类。 3.单样本基因集...
今天我们要讲的主角是与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）密切相关的HIF-1α基因。HIF-1α基因简介 HIF1（hypoxia inducible factor-1），中文名低氧诱导因子-1，HIF1是由两个基本的螺旋-环-螺旋PAS（Per-ARNT-Sim）蛋白HIF1-Alpha和HIF1-Beta组成的异二聚体。HIF-1α在缺氧条件下会累积表达，而HIF1β则是组成型...
论文第一作者、Weiss实验室的科学家Ruopeng Feng博士发现,一种激活细胞缺氧反应的一部分的药物抑制了来自成年镰状细胞病患者的红细胞发生镰变。这种药物是一种脯氨酸羟化酶抑制剂,可使HIF1聚集并结合γ-珠蛋白基因附近的DNA调控区,激活该基因转录,从而产生HbF并抑制红细胞发生镰变。 HIF1α激活成体红细胞中的γ-...
研究首先利用基因集变异分析（GSVA）对HIF-1信号通路的富集进行量化，进而进行无监督聚类分析，成功地将PCa样本分为HIF-1高（HIF-1_H）、HIF-1中（HIF-1_M）和HIF-1低（HIF-1_L）三个亚型。功能富集分析揭示，HIF-1_H亚型中，癌症相关和免疫相关通路被显著激活，而HIF-1_L亚型则在细胞周期和...
作者对IOX5处理组与非处理组的AML细胞和HIF-1α敲除组和未敲除组的细胞分别进行转录组分析,并将基因集富集结果进行比对,发现IOX5处理之后富集的基因集在HIF-1α敲低组中下调,反之亦然。进一步分析显示,IOX5处理的细胞中上调和下调...
HIF-1α属于bHLH-PAS (basic-helix-loop-helix-Per-Arnt-Sim) 家族的转录因子【1】，在缺氧条件下HIF-1α亚基稳定，转位到细胞核，异源二聚化后激活下游的基因途径，从而减少细胞耗氧量、减少活性氧（Reactive oxygen species，ROS），恢复心肌细胞群中的供氧。关于HIF-1α的研究一直集中在心肌细胞中，但是其在...
于是,他们尝试在肝脏特异性敲除HIF1α基因(HIF1α-HKO)后再用LEF治疗CIA诱导的RA模型,发现大鼠的骨侵蚀程度得到极大的缓解(图6C-E)。作为CRP的帮凶,FDA批准药物Acriflavine(ACF)就是HIF1α的特异性抑制剂,用ACF处理CIA诱导的RA模型可以起到与HIF1α-HKO类似的治疗效果。
(spinal cord ischemia-reperfusion injury,SCII)作为原发性脊髓损伤后的继发性损害是造成神经细胞损 伤的一个重要因素,目前基因和细胞移植治疗 SCII 尚处于探索阶段.低氧诱导因子 -1(hypoxia-inducible factor-1,HIF-1)产生并处 于缺氧应答的关键环节,在缺血后细胞凋亡及微循环的重建等方面起关键作用,用其转染骨髓...
为了评估观察到的同一肿块不同区域的Wnt配体/细胞内效应物的不平衡是否会影响GBM患者的预后,我们在TCGA GBM肿瘤数据集中寻找任何Wnt细胞内途径成分(图7C)过表达的肿瘤。表现出7个或更多“Wnt基因”过表达的GBM患者(图7C的水平图中列...