[3]: Li, G., Cai, L., Chang, H., Hong, P., Zhou, Q., Kulakova, E. V, … Ruan, Y. (2014). Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag (ChIA-PET) sequencing technology and application. [4]: Dekker J, Rippe K, Dekker M, Kleckner N (February 2002). "Capturing chromos...
与此几乎同时,还诞生了ChIA-PET (chromatin interaction analysis by paired-end tag sequencing,染色质相互作用的配对末端标记测序分析)技术。跟3C升级到Hi-C相类似,ChIA-PET可以看作ChIP-loop的提升版,从研究单环形成过程中的蛋白质作用转变为研究染色体3D结构形成中的蛋...
Hi-C是染色质区域捕获(Chromosome conformation capture)与高通量测序(High-throughput sequencing)相结合而产生的一种新技术。通过甲醛处理将DNA与蛋白质交联在一起从而固定DNA的构象,并进行酶切、生物素引入、酶连和提取,然后对处理好的核酸进行文库构建和高通量测序,最终通过对测序数据进行分析即可揭示染色体片段间的交...
Hi-C (Chromosome conformation capture followed by high-throughput sequencing)技术的原理是,利用甲醛交联固定细胞核内染色质的三维结构,将DNA进行酶切和原位重新连接,此时DNA片段的相互作用几率便可反映其在三维空间上的相对距离。通过对全基因组DNA远距离相互作用进行捕获,结合高通量测序技术及生物信息分析,最终可获得...
Recent research-based advancements in three-dimensional (3D) genomics, particularly high-throughput chromatin conformation capture (Hi-C) sequencing, have allowed for the identification of chromosome fusions and provided mechanistic insights into three muntjac species: Muntiacus muntjak, M. reevesi, and ...
Li, G., Cai, L., Chang, H., Hong, P., Zhou, Q., Kulakova, E. V, … Ruan, Y. (2014). Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag (ChIA-PET) sequencing technology and application.↩︎ Dekker J, Rippe K, Dekker M, Kleckner N (February 2002). “Capturing chromosome con...
ATAC-seq CUT&Tag ChIP-seq Hi-C HiChIP/ChIA-PET Capture Hi-C GRID-seq DNA Methylation Next Generation Sequencing Genome Re-sequencing Transcriptome Sequencing Human Whole Exome Sequencing Capture Sequencing Microbial Sequencing Product introduction Result Presentation Technical advantages Literature In...
Nature子刊最新研究：Hi-C宏基因组揭示土壤-噬菌体-宿主相互作用 土壤中有大量的噬菌体。然而，大多数宿主未知，无法获得其基因组特征。2023年11月23日，最新发表于《Nature communications》期刊题为“Hi-C metagenome sequencing reveals soil phage–host interactions”的文章，通过高通量染色体构象捕获（Hi-C）技术来...
土壤中有大量的噬菌体。然而,大多数宿主未知,无法获得其基因组特征。2023年11月23日,最新发表于《Nature communications》期刊题为“Hi-C metagenome sequencing reveals soil phage–host interactions”的文章,通过高通量染色体构象捕获(Hi-C)技术来直接捕获土壤中噬菌体与宿主的关系,为噬菌体介导的土壤细菌种群动力学...
土壤中有大量的噬菌体。然而,大多数宿主未知,无法获得其基因组特征。2023年11月23日,最新发表于《Nature communications》期刊题为“Hi-C metagenome sequencing reveals soil phage–host interactions”的文章,通过高通量染色体构象捕获(Hi-C)技术来直接捕获土壤中噬菌体与宿主的关系,为噬菌体介导的土壤细菌种群动力学...