hi-c 测序原理 Hi-C测序是一种高通量基因组测序技术,用于研究染色体的三维空间结构和基因组互作。它基于染色体的物理交联,通过将相互靠近的染色体区域连接在一起,从而揭示染色体上不同区域之间的相互作用。 Hi-C测序的原理可以分为以下几个步骤: 1. 交联,首先,细胞核内的染色体被交联,使得靠近的染色体区域之间形成...
该研究利用了PacBio三代分子测序和北京百迈客生物技术有限公司的Hi-C技术绘制了三个高质量棉花基因图谱,发现了三种棉花中多个染色体易位与倒位事件,解决了围绕A基因组起源的现有争议性概念,确定了与棉花纤维长度这一重要农艺性状相关的丰富的候选基因,并为棉花遗传改良提供了宝贵的基因组资源。 图1、草棉与亚洲棉基因...
Hi-C的文库制备也基于交联原理,但是使用了二代测序代替通过引物进行的捕获方式,使得捕获范围可以增加到全基因组水平。 Hi-C在交联反应之后同样使用限制性内切酶将染色质片段化,更进一步,Hi-C使用生物素标记的碱基作为修复材料,对内切酶形成的粘性末端进行修复并链接成环。在对得到的混合物进行反交联,纯化和剪切后,再...
基因组染色质是如何折叠组装,而这种折叠又是如何调节基因转录表达的,一直是三维基因组学关注和研究的热点。 Hi-C测序技术已成为研究者们解析三维基因组学的利器,为研究基因的转录表达调控机制提供了新思路,目前已经用于包括细胞周期、人及动植物发育和疾病的发生发展等方面的研究。 问题来啦,Hi-C技术是如何解析基因组...
Hi-C测序技术已成为研究者们解析三维基因组学的利器,为研究基因的转录表达调控机制提供了新思路,目前已经用于包括细胞周期、人及动植物发育和疾病的发生发展等方面的研究。 问题来啦,Hi-C技术是如何解析基因组的三维信息,又是如何通过测序数据来解析基因组三维调控信息的?本期在线交流主讲HiC-Pro、HiTC的应用和Hi-C...
测序原理 Solexa是一种基于边合成边测序技术（Sequencing-By-Synthesis，SBS）的新型测序技术。通过单分子阵列实现在小型芯片（FlowCell）上进行桥式PCR反应。通过可逆阻断技术实现每次只合成一个碱基，再利用相应的激光激发荧光集团，捕获激发光，从而读取碱基信息。Flowcell 宽25mm×长75mm cBot 可逆阻断技术 Hiseq Sequen...
Hi-C是一种染色质区域捕获与高通量测序相结合的新技术。其原理是通过甲醛处理将DNA与蛋白质交联在一起,从而固定DNA的构象。然后进行酶切、生物素引入、酶连和提取,对处理好的核酸进行文库构建和高通量测序。通过对测序数据进行分析,可以揭示染色体片段间的交互信息,仅利用单个个体就可以将基因组序列定位到染色体,从而...
测序原理 Solexa是一种基于边合成边测序技术（Sequencing-By-Synthesis，SBS）的新型测序技术。通过单分子阵列实现在小型芯片（FlowCell）上进行桥式PCR反应。通过可逆阻断技术实现每次只合成一个碱基，再利用相应的激光激发荧光集团，捕获激发光，从而读取碱基信息。Flowcell 宽25mm×长75mm cBot 可逆阻断技术 Hiseq Sequen...
测序原理 Solexa是一种基于边合成边测序技术（Sequencing-By-Synthesis，SBS）的新型测序技术。通过单分子阵列实现在小型芯片（FlowCell）上进行桥式PCR反应。通过可逆阻断技术实现每次只合成一个碱基，再利用相应的激光激发荧光集团，捕获激发光，从而读取碱基信息。Flowcell 宽25mm×长75mm cBot 可逆阻断技术 Hiseq Sequen...