p=23 Hi-C与其他三维基因组技术特点 HiC技术实验原理 将三维基因组甲醛交联固定,用内切酶进行酶切,酶切完在末端加生物素进行末端修复,然后进行连接,连接后对去除蛋白并打断成小片段,用磁珠捕获带生物素的片段进行测序。 Hi-C分析流程 (a)首先是质控,过滤后高质量的FASTQ数据(PE,150bp),如果比对软件不支持split ...
通过这些实验流程，并基于生物信息学数据分析，Hi-C技术能够获得全基因组范围内所有序列间的互作信息，从而揭示基因的空间远程调控机制，重构染色质三维空间结构模型。准确的信息分析结果源于良好的实验数据的获得，由于Hi-C技术对实验操作的要求较高，为了准确评估实验过程的无误性，追踪溯源，因此我们会对实验过程进行严...
Hi-C技术的基本原理是通过对细胞内的染色体进行特殊的化学修饰,使得相邻的染色体片段之间的特殊碱基对在经过特殊条件下可以连接在一起。然后,将修饰后的染色体分解成较小的片段,并使用高通量测序技术来测定这些片段在染色体中出现的频率。根据这些信息,研究人员可以推断出染色体中基因之间的相对位置关系,并建立染色体构象图...
Hi-C测序技术原理 Hi-C是染色质区域捕获(Chromosome conformation capture)与高通量测序(High-throughput sequencing)相结合而产生的一种新技术。通过甲醛处理将DNA与蛋白质交联在一起从而固定DNA的构象,并进行酶切、生物素引入、酶连和提取,然后对处理好的核酸进行文库构建和高通量测序,最终通过对测序数据进行分析即可...
Hi-C测序的原理可以分为以下几个步骤: 1. 交联,首先,细胞核内的染色体被交联,使得靠近的染色体区域之间形成物理上的连接。这一步骤通常使用一个交联剂(一般是甲醛)来进行。 2. 切割,交联后的染色体被切割成小片段,通常使用一种限制性内切酶(如HindIII)来切割染色体。这些酶切位点通常位于基因组中的特定位置,从而...
一、技术原理 Hi-C是染色质区域捕获(Chromosome conformation capture)与高通量测序(High-throughput sequencing)相结合而产生的一种新技术。 以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。
Hi-C原理: 1、使用甲醛使细胞核内空间上靠近的DNA片段形成共价键 2、使用内切酶将染色质片段化 3、用生物酰化的核酸分子连接酶切形成粘性末端 4、纯化并片段化DNA,用链霉亲和素的磁珠富集喊生物酰化的连接片段 5、对收集的片段建库并进行双末端测序
二、原理及步骤 三、三维基因组检测技术比较 1、C技术 3C(一对一) 4C(一对多) 5C(多对多) Hi-C(全部互作) 2、基于免疫沉淀技术 ...