library(hgu133plus2.db)ids=toTable(hgu133plus2SYMBOL)#toTable这个函数:通过看hgu133plus2.db这个包的说明书知道提取probe_id(探针名)和symbol(基因名)的对应关系的表达矩阵的函数为toTablehead(ids)#head为查看前六行colnames(ids)=c('probe_id','symbol')ids=ids[ids$symbol!='',]dim(ids)#419222ids...
acc=GPL14877 但是,我在在利用hgu133plus2.db进行探针名转换为基因名时出现问题 ,代码如下: library(hgu133plus2.db) ids=toTable(hgu133plus2SYMBOL) #toTable这个函数:通过看hgu133plus2.db这个包的说明书知道提取probe_id(探针名)和symbol(基因名)的对应关系的表达矩阵的函数为toTable head(ids) #head为...
hgu133plus2 Tag Archives:hgu133plus2 七01 自学miRNA-seq分析第七讲~miRNA样本配对mRNA表达量获取 Posted on2016年7月1日 这一讲其实算不上是自学miRNA-seq分析,本质就是affymetrix的mRNA表达芯片数据分析,而且还是最常用的那种GPL570 HG-U133_Plus_2,但是因为是跟miRNA样本配对检测的,而且后面会利用到这两个...
但是,我在在利用hgu133plus2.db进行探针名转换为基因名时出现问题 ,代码如下: library(hgu133plus2.db) ids=toTable(hgu133plus2SYMBOL)#toTable这个函数:通过看hgu133plus2.db这个包的说明书知道提取probe_id(探针名)和symbol(基因名)的对应关系的表达矩阵的函数为toTablehead(ids)#head为查看前六行colnames(...
另外一种解决方法是：按两次“TAB”键后，“OK“按钮 即可点亮。 --- 另 --- 复制CRACK名称为ALTERA.DAT(或另一license.dat文件)的LICENSE文件,到MAX+plus II 的安装目录下（如d:\maxplus2）。 运行MAX+plus II，进入MAX+plus II集成环境，选择"Option"-> "License Setup"菜单，弹出一个对话...
Library - package hgu133plus2cdf not installed此外: Warning messages:1: 运行命令'"C:/Program Files/R/R-34~1.2/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Program Files\R\R-3.4.2\library" C:\Users\ADMINI~1\AppData\Local\Temp\Rtmp8MauYh/downloaded_packages/hgu133plus2cdf_2.18.0.tar.gz'的状态...
quality of microarry data available via the Gene Expression Omnibus (GEO) using more than 22,000 Affymetrix HGU133a and HGU133plus2 arrays from 809 ... MN Mccall,PN Murakami,M Lukk,... - 《Bmc Bioinformatics》 被引量: 92发表: 2011年 METHODOLOGY ARTICLE Open Access Assessing affymetrix Gen...
limma,org.Hs.eg.db, BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, hgu133plus2.db 来自 Citeseer 喜欢 0 阅读量: 76 作者:M Lawrence,V Carey,R Gentleman,R Depends 摘要:Suggests humanStemCell, microRNA (> = 1.1.1), genefilter年份: 2013 ...
BiocManager::install("hgu133plus2cdf")options(warn =-1)library(hgu133plus2cdf)如果报错请参考资料...
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