首先,使用Miniconda安装了R 4.4版本。由于之前在旧版本上安装过HDF5R包,直接将整个文件复制到新系统的lib目录下。 遇到的问题 😵 调用时发现缺少libhdf5_serial.so.100文件(如图1所示)。使用ldd命令检查home/xxx/miniconda3/lib/R/library/hdf5r/libs/hdf5r.so共享库列表,发现只有103文件(如图2所示)。 检查模块...
centos-hdf5r安装 可能性之兽关注IP属地: 陕西 0.3672024.02.02 13:56:35字数 448阅读 336 wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.5/src/hdf5-1.10.5.tar.gz tar xvf hdf5-1.10.5.tar.gz cd hdf5-1.10.5./configure--prefix=/usr/local/hdf5makemakecheck sudomake...
解压缩后,./configure--prefix=/usr/local/hdf5,make,make install 在R中, install.packages("hdf5r",configure.args="--with-hdf5=/usr/local/hdf5/bin/h5cc") 参考: 简书-centos-hdf5r安装 CSDN-centos7系统中安装 HDF5R 包
今天的一個報錯:R包hdf5r安装失败 解決方法: 在終端輸入:sudoapt-getinstall libhdf5-dev 最後安裝成功
简介: CentOS7下安装hdf5r包 使用Seurat安装hdf5r报错 安装hfd5r报错 configure: error: The version of hdf5 installed on your system is not sufficient. Please ensure that at least version 1.8.13 is installed ERROR: configuration failed for package ‘hdf5r’ 1. 下载hdf5-1.8.13的源码 wget https:/...
cd hdf5-1.10.5 ./configure --prefix=/usr/local/hdf5 make make check sudo make install sudo make check-install 这时候安装hdf5r的时候提示请安装 hdf5r-devel。 然后在 这和 这发现 hdf5r 的安装依赖 h5cc,因为是自己安装的 hdf5,所以需要手动指定 h5cc 路径 ...
ERROR: configuration failed for package ‘hdf5r’解决办法:1. 下载hdf5-1.8.13的源码wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.8/hdf5-1.8.13/src/hdf5-1.8.13.tar.bz2 2. 编译安装tar xjf hdf5-1.8.13.tar.bz2 cd hdf5-1.8.13 ./configure --prefix=$HOME/.local/bin/hdf5-...
1. sudo apt-get install libhdf5-dev 2. install.packages("hdf5r", configure.args="--with-hdf5=/usr/bin/h5cc")
安装hdf5r包时报错：checking for h5cc... no checking for h5pcc... no checking for HDF5 libraries... no 搜了一下，将hdf5/bin下的文件软连接到/usr/local/bin 总算能找到h5cc了，但还是报错：libhdf5_hl.so.100: cannot open shared object file: No such file or directory 查了下...
在安装hdf5r的时候,要求安装依赖bit64。 安装bit64时会遇到报错, /Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/sys/resource.h:197:2: error: unknown type name 'uint64_t' uint64_t ri_user_time; 解决方案为重命名/usr/local/include文件夹 ...