首先,使用Miniconda安装了R 4.4版本。由于之前在旧版本上安装过HDF5R包,直接将整个文件复制到新系统的lib目录下。 遇到的问题 😵 调用时发现缺少libhdf5_serial.so.100文件(如图1所示)。使用ldd命令检查home/xxx/miniconda3/lib/R/library/hdf5r/libs/hdf5r.so共享库列表,发现只有103文件(如图2所示)。 检查模块...
在R中安装rhdf5包,可以使用以下指令: R if (!require("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rhdf5") 详细步骤说明: 检查并安装BiocManager: BiocManager是Bioconductor包的安装工具。首先检查是否已经安装了BiocManager,如果没有安装,则先安装它。 R if (!require...
在安装 hdf5r 包的时候,提示需要 hdf5-devel >= 1.8.13,而目前CentOS 7 中 yum 只能安裝1.8.12版本,所以只能手动安装高版本的hdf5. 卸载yum安装旧版本后,从官网下载 hdf5-1.10.5安装 wgethttps://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.5/src/hdf5-1.10.5.tar.gz tar xvf hdf5-1...
ERROR: configuration failed for package ‘hdf5r’解决办法:1. 下载hdf5-1.8.13的源码wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.8/hdf5-1.8.13/src/hdf5-1.8.13.tar.bz2 2. 编译安装tar xjf hdf5-1.8.13.tar.bz2 cd hdf5-1.8.13 ./configure --prefix=$HOME/.local/bin/hdf5-1.8...
在安装hdf5r的时候,要求安装依赖bit64。 安装bit64时会遇到报错, /Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/sys/resource.h:197:2: error: unknown type name 'uint64_t' uint64_t ri_user_time; 解决方案为重命名/usr/local/include文件夹 cd /usr/local sudo mv include include...
安装hdf5r包时报错：checking for h5cc... no checking for h5pcc... no checking for HDF5 libraries... no 搜了一下，将hdf5/bin下的文件软连接到/usr/local/bin 总算能找到h5cc了，但还是报错：libhdf5_hl.so.100: cannot open shared object file: No such file or directory 查了下...
macports-packages-R-rhdf5安装包是阿里云官方提供的开源镜像免费下载服务,每天下载量过亿,阿里巴巴开源镜像站为包含macports-packages-R-rhdf5安装包的几百个操作系统镜像和依赖包镜像进行免费CDN加速,更新频率高、稳定安全。
centos-hdf5r安装 wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.5/src/hdf5-1.10.5.tar.gz tar xvf hdf5-1.10.5.tar.gz cd hdf5-1.10.5./configure--prefix=/usr/local/hdf5makemakecheck sudomakeinstall sudomakecheck-install...
解压缩后,./configure--prefix=/usr/local/hdf5,make,make install 在R中, install.packages("hdf5r",configure.args="--with-hdf5=/usr/local/hdf5/bin/h5cc") 参考: 简书-centos-hdf5r安装 CSDN-centos7系统中安装 HDF5R 包
安装R包(“clonotypeR“) clonotypeR 包,可整合免疫组库(VDJ)与scRNA-seq; 主要函数包括AddClonotypes()和LoadClonotypes()。安装代码如下:...r语言安装r包 r语言安装r包2020 首先根据r包存储的地方,就可以分为三种下载方式 CRAN bioconductor GitHub 其他安装方式 首先根据r包存储的地方,就可以分为三种下载...