在HD-Zip Ⅰ的C端发现了AHA保守序列,该序列形成了双亲带负电荷的螺旋结构,使C端具有激活转录功能[10]。AHA CTR 和NTR区域通过控制磷酸化与泛素化对转录激活功能进行调节[11]。HD-Zip Ⅱ亚家族蛋白N末端存在保守的L×L×L结构域(Leu×Leu×Leu)和ZI...
hd-zip 类转录因子HD-ZIP (Homeodomain-Leucine Zipper) 类转录因子是一类具有高度保守的DNA结合结构域homeodomain和一个Leucine Zipper(一个具有富含亮氨酸的序列)的植物转录因子。它们在植物发育和生理过程中起着关键作用,包括调控种子植物胚胎发育、组织器官分化、干旱和盐胁迫响应等。 HD-ZIP 类转录因子通常在干旱、...
HD-Zip在细胞内存在于细胞核中,由同源异型区域和亮氨酸拉链区域组成。同源异型区域是HD-Zip的DNA结合结构域,能够与DNA结合并调控靶基因的转录。而亮氨酸拉链区域则能够与其他亮氨酸拉链区域形成二聚体结构,增强调节效应。 2. HD-Zip的功能 HD-Zip在植物的生长和发育过程中起着重要的调节作用。它参与了植物的根、...
大麻HD-Zip基因中内含子和外显子数量的差异反映了大麻HD-Zip家族成员之间的结构多样性,而在进化树的同一分支成员之间的外显子数量更为一致。 图4. HD-Zip基因的结构。A. CsHD蛋白的系统发育树。B. CsHD蛋白的保守结构域。C. CsHD基因结构和保守结构域。内含子用黑线表示。 启动子区域不同的顺式作用元件通常...
国外研究团队发表在New Phytologist上的一篇开创性研究,揭示了拟南芥中HD-Zip IV转录因子PDF2的START结构域在维持磷脂和游离脂肪酸稳态中的核心作用,不仅深化了我们对植物脂质代谢调控机制的理解,还为探索START结构域在植物磷响应、生长调控及环境适应中的新功能提供了新视角,对植物发育和环境适应性的研究具有重要意义。
HD-Zip 家族蛋白是植物特有的转录因子,编 码含有 60 个保守氨基酸同源结构域(HD)的同源 异型盒(Homeobox)蛋白.在植物中,第一个含有 HD 的基因在玉米(Zea mays)中被报道,发现了一 个控制叶片分化机制的 Knotted1[9].目前,在拟南 芥,水稻,小麦,玉米,马铃薯,大麦,番茄,向 日葵和苜蓿中均发现了该基因[10-...
具体的,对于构建某一基因家族的进化树(以HD-ZIP3家族)来说分析流程如下: 基因家族分析流程 二、软件的准备 具体软件包括有: 比对软件:blast、hmmer 多序列比对:mafft、pal2nal.pl 保守信息位点筛选:Gblocks 系统进化树(ML树)的构建:iqtree 万能fastq/fasta小工具:seqkit ...
在本研究中,我们报道了同源结构域亮氨酸拉链(HD-ZIP)IV转录因子GhHOX4在纤维伸长中起重要作用。 GhHOX4基因在棉花中的过表达导致纤维长度增加,而GhHOX4基因沉默的转基因棉花与野生型相比表现出“短纤维”表型。 GhHOX4直接激活两个靶基因GhEXLB1D和GhXTH2D,促进纤维伸长。另一方面,与细胞信号和代谢相关的磷脂酸...
1.3 辣椒HD-Zip家族成员结构和保守结构域分析 HD-Zip的外显子和内含子位置信息参考辣椒基因组注释信息GFF文件,之后应用本地perl语言提取位置信息转变为GSDS(Gene Structure Display Server;http://gsds.cbi.pku.edu.cn)可读bed文件。应用在线工具GSDS进行HD-Zip结构的绘制。
HD-Zip转录因子属于Homeobox蛋白家族,是植物特异转录因子,由高度保守的HD(Homeodomain)结构域和Leu zipper(Zip)元件组成,前者与DNA特异结合,后者介导蛋白二聚体的形成.HD-Zip转录因子家族包括4个亚家族(HD-ZipⅠ-Ⅳ),其成员通过与其他蛋白互作,参与激素介导的信号途径,从而调控植物生长发育,光形态建成,花发育,果实发...