长链L(3.2kb)为负链,而短链S为正链,基因组依靠正链5'端约240bp的粘性末端与负链缺口部位的互补维持了环状结构。在两条链的互补区两侧各有一个11碱基的直接重复序列(5'-TTCAC-CTCTGC-3'),分别开始于第1842和1590核苷酸处,称为DR1和DR2。 S编码区编码乙肝表面抗原蛋白,分别编码由226个氨基酸残基的表面抗原...
如图2.1所示,HBV基因组的松弛环状结构由粘性末端区域维持,该区域包含两个由11个核苷酸(TTCACCTCTGC)组成的直接重复序列(direct repeats,DRs),分别称为DR1(nt1824-1834)和DR2(nt1590-1600)。DR1和DR2在病毒复制和HBV DNA序列整合进宿主细胞基因组的过程中发挥重要作...
图1.通过逆向PCR测量HBV DNA整合和肝细胞克隆数量:A.逆向PCR依赖于HBV DNA整合序列中靠近DR1-DR2区域的在整合位点的限制性内切酶NcoI酶切位点,及临近整合位点的人基因组序列中存在另一个NcoI切点,随后切割产生的嵌合了人及病毒DNA的切割...
P蛋白RNase H结构域同时降解HBV DNA-RNA杂合双链中的pgRNA；（C）负链DNA合成完成时，pgRNA 被降解仅保留5’端16-18 nt的RNA引物；（D）RNA引物发生第二次跳转，跳转至5’端的DR2区；（E）负链合成一段之后发生第三次跳转，与负链3’末端DR1区互补；（F...
既往的一些研究已经提出了双链线性形式的HBV基因组整合过程中的病毒DNA来源的假说:在逆转录完成负链DNA合成后,残留的、起始于nt1818且包括了DR1序列的RNA引物,如果在HBV DNA复制过程中未能正确地跳转到新合成负链的DR2区,则在新生的...
研究人员还观察到，由非整合HBV引起的转录本，通过3.2kb的读码来鉴定，不包括宿主序列。把宿主/HBV嵌合读数与来自相同肝组织活检的RNA序列数据进行比较，以匹配转录物与特定整合事件。一些与HBV直接重复序列（DR1和DR2）无关的部分整合事件被发现，尽管被插入或靠近宿主基因位点，但在转录上表现出沉默。大多数转录...
在19个测序成功的HBV血浆样本中,只有2个观察到HBV-人嵌合序列读数。嵌合序列病毒和宿主序列的断点分别位于HBV X基因与人类9号染色体(患者4)和15号染色体(患者17)之间,嵌合序列中的HBV序列分别终止于DR1和DR2附近的1793(患者4)和1646...
该带有DR1序列的RNA片段将是病毒正链DNA合成的引物,多数情况下,该引物会跳转结合到新合成的病毒负链DNA的DR2区(与残留pgRNA片段的DR1互补)引导正链DNA的合成,形成开链环状的rcDNA(90%,a);如若未发生跳转而在原位直接启动正链合成,则...
此外, X-ORF还包括顺式作用原件:核心上游调节序列、负性调节元件、增强子Ⅱ,基本核心启动子(BCP),直接重复序列1、2(DR1、DR2)也重叠在X-ORF。 发生在3′端的缺失突变是X-ORF的主要突变,常见的有nt1763-1770、nt1770-1777、nt1753-1772、nt1750-1770等8...
培养上清中的HBV RNA的3’末端大多数定位在类似细胞内RNA 3’末端定位到的DR2和DR1之间的区域(26/33),极少数3’端位于DR1下游或poly(a)尾处(图9B),表明培养上清中的HBV RNA主要是来源于细胞内3’末端截短的RNA。考虑到培养...