为了应对这一挑战,作者生成了第一代茶单倍型图谱 (Tea HapMap-1)。茶树的异交和高度杂合性质,使它们在 DNA 水平变异中变得更加复杂。 在本研究中,使用 369 个茶基因型的全基因组重测序数据生成 2,334,564 个双等位基因 SNP 和 1,447,985 个 InDels。产生了大约 2928.04 百万个双端读数,平均映射深度为 ~0...
本研究的人群与东亚人群聚集在一起,并与东亚人间表现出很强的遗传相似性,(平均FST值为0.0161),而与非洲人遗传距离最大(平均FST值为0.0398),证明MiniHap在洲际间祖源推断方面表现出卓越的性能,其效能与Precision ID Ancestry Panel(165个SNPs)相媲美。
应用Hapmap数据库分析HBG1-HBD基因间序列单倍型及标签SNP的挑选 韩文平;黄盛文;黄凌;王偲颖;韩媛媛;王予川;安邦权 【期刊名称】《医学研究生学报》 【年(卷),期】2016(029)012 【摘要】Objective The HBG1-HBD intergenic region plays an important role in the expression of the gamma globin gene . ...