2024年3月29日,江西农业大学黄路生院士团队利用292只猪肝脏的组蛋白H3第27位赖氨酸乙酰化(H3K27ac)的ChIP-seq数据注释了90991个高质量调控元件。结合基因组重测序和RNA-seq数据,共鉴定出28425个H3K27ac数量性状位点(acQTL)和12250个表达数量性状位点(eQTL)。通过等位基因不平衡分析在独立数据集中验证了两个因果性...
2024年3月29日,江西农业大学黄路生院士团队利用292只猪肝脏的组蛋白H3第27位赖氨酸乙酰化(H3K27ac)的ChIP-seq数据注释了90991个高质量调控元件。结合基因组重测序和RNA-seq数据,共鉴定出28425个H3K27ac数量性状位点(acQTL)和12250个表达数量性状位点(eQTL)。通过等位基因不平衡分析在独立数据集中验证了两个因果性...
关于易基因染色质免疫共沉淀测序 (ChIP-seq) 染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术,可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,为研究的深入开展打下基础。 DNA与蛋白质的相互作用与基...
2024年3月29日,江西农业大学黄路生院士团队利用292只猪肝脏的组蛋白H3第27位赖氨酸乙酰化(H3K27ac)的ChIP-seq数据注释了90991个高质量调控元件。结合基因组重测序和RNA-seq数据,共鉴定出28425个H3K27ac数量性状位点(acQTL)和12250个表达数量性状位点(eQTL)。通过等位基因不平衡分析在独立数据集中验证了两个因果性...
单细胞ChIP-seq技术可实现单细胞层面组蛋白修饰信息挖掘,对于癌症中肿瘤异质性发掘具有非常重要的作用。2019年Annabelle Gérard 研究团队用单细胞ChIP-seq技术实现乳腺癌染色质状态的异质性检测,发掘出敏感肿瘤中罕见细胞的耐药染色质特征[9]。 爱基百客提供领先表观组学技术服务,推出新产品单细胞ChIP-seq,个性化分析...
ChIP-seq raw reads were filtered to remove input read ends with poor quality values (quality score 20) and then aligned to the hg19 chomosome 11 reference genome using Bowtie2. Aligned BAM files wer…
遗传变异可以通过改变调控元件来改变基因表达,从而影响复杂性状。然而,影响猪调控元件活性的遗传变异很大程度上未知,这些变异在多大程度上影响基因表达和助力理解复杂表型仍不清楚。 2024年3月29日,江西农业大学黄路生院士团队利用292只猪肝脏的组蛋白H3第27位赖氨酸乙酰化(H3K27ac)的ChIP-seq数据注释了90991个高质量调...
因此可通过CHIP-seq 分析组蛋白修饰的分布寻找基因的启动子区和增强子区域及其是激活或抑制基因表达。 H3K4me1可作为增强子的标志,H3K4me3作为启动子标志。研究表明,H3K4me1和H3K4me3与基因激活相关,H3K4me3主要富集在转录起始位点附近的启动子区域,而大多数H3K4me1修饰富集在增强子区域;H3K27ac与基因激活相关,主要富集在...
乙酰化修饰H3K27ac的变化是阿尔兹海默症发生的重要影响因素,对H3K27ac的研究有助于理解阿尔兹海默症发生机制和进程原因。 也想来一套H3K27ac ChIP-seq? 地址:武汉市东湖高新技术开发区高新大道666号光谷生物城C1栋 电话:027-65527552...
EpiCypher是一家为表观遗传学和染色质生物学研究提供高质量试剂和工具的专业制造商。EpiCypher推出的ChIP级别的Histone H3K27ac Antibody符合EpiCypher的“SNAP-ChIP® Certified”标准,用于ChIP实验中的特异性和有效靶标富集(整板的交叉反...