在GWAS研究中,还有一种常用的图形就是Q-Q plot,虽然它的颜值可能不如曼哈顿图, 但是它表达的信息比曼哈顿图要丰富得多😽, 相当于GWAS研究的质控图。 1.2 Q-Q plot的原理是什么? Q-Q plot全称是quantile-quantile plot,也就是分位图,基本原理是通过比较两个概率分布的分位数,从而实现对两个概率分布进行比较。
在某些文章中,会将各种模型的分析结果的P value画在一张QQ plot中,然后比较哪种模型更加合理。例如图5(a)的QQ plot中,我们可以推断:K模型和Q+K模型是合理的,但GLM和Q模型则存在过于严重的假阳性。 图5 不同模型分析结果合并绘制QQ plot进行比较 更多关于GWAS分析原理,模型中包含的因素以及以上图形更详细的解读...
GWAS: 曼哈顿图,QQ plot 图,膨胀系数( manhattan、Genomic Inflation Factor) 想要高级感的曼哈顿图 对曼哈顿图(Manhattan plot )多个显著位点标志不同颜色,拒绝屎一样的绿色 对性染色体进行关联分析 3.3.4 meta分析 只用一行命令,就可以学会全基因组关联分析(GWAS)的meta分析 beta/or, se, p, zscore换算总结帖 ...
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