其原因是,不同的人体组织表达的基因并不相同。GTEx项目,通过收集健康人体的不同组织样本,尝试了解人类不同组织/器官的特异性基因表达。 从本期开始,我们将介绍GTEx数据库。这是一个值得大家深度学习的数据库。GTEx项目,全称Genotype-TissueExpression (基因型-组织表达) ,主要由美国NIH(国立卫生研究院)的公共基金计划...
;基因型-组织表达研究联盟”(Genotype-TissueExpressionConsortium)。目前,GTEx项目已经建立了一个数据资源和组织库,用于研究在多种人类组织和个体中...疾病风险和促进疾病特征的发展。据悉,本周发表的15篇最新论文基于GTExV8版本数据集。研究人员对来自838名死亡捐赠者49个组织的15,201份样本进行了RNA测序,并分析了每个...
FarmGTEx地址:https://www.genome.gov/Funded-Programs-Projects/Genotype-Tissue-Expression-Project GTEx项目最初来自人类研究,全称Genotype-Tissue Expression (基因型-组织表达),旨在建立全面的公共资源来研究组织特异性基因的表达和调控,即找到序列与实际性状(疾病)的关系,确定不同基因究竟如何影响表达。GTEx计划是现有...
GTEx基因表达数据库 Genotype-Tissue Expression(GTEx):GTEx数据库是一个由美国国立卫生研究院(NIH)资助的项目,旨在研究基因型和组织表达之间的关系。 该数据库包含了来自838位生前健康的人类捐献者的DNA数据(包括Whole Genome Sequencing和W...
疑惑一:什么是GTEx数据库? 答:GTEx全称是Genotype-Tissue Expression,称为基因型组织表达。GTEx首次出现是2013年在Nature Genetics杂志上发表的文章The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project中,该文中首次介绍了Genotype-Tissue Expression,并成立了Genotype-Tissue Expression Consortium。2015年发表在Science上标题为The...
GTEx项目对来自人体多个组合和器官的样本,同时进行了转录组测序和基因分型分析,构建了一个组织特异性的基因表达和调控的数据库:Genotype-Tissue Expression (GTEx) 1. 背景知识 一期 2015年,GTEx发布了第一个阶段性成果,一次性在Science杂志上发表三篇研究成果,该成果还被选为封面文章。GTEx的研究从175名死者身上采集...
GTEx项目最初来自人类研究,全称Genotype-Tissue Expression (基因型-组织表达),旨在建立全面的公共资源来研究组织特异性基因的表达和调控,即找到序列与实际性状(疾病)的关系,确定不同基因究竟如何影响表达。GTEx计划是现有规模最大的人类器官转录组研究计划,主要由美国NIH(国立卫生研究院)的公共基金计划连续资助了10年(20...
最近,基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression, GTEx)研究联盟(GTEx Consortium)分别在本期期刊的第648页、第660页和第666页上发表了第一批转录研究的结果(其中包括Melé等人和Rivas等人的研究成果),从而填补了此类研究的空白。 多种组织内的转录本表达丰度在不同的个体之间存在着差异。为了了解导致这种个体差异的...
GTEx,全称Genotype-Tissue Expression。这个数据库和TCGA和ICGC不同的是。TCGA和ICGC更多的还是肿瘤相关的数据,而GTEx收集的是正常人身上的组织来进行的测序,所以GTEx数据库包括的就只是正常人的数据。 这个数据集的用处呢,一方面是可以研究正常人不同组织之间的基因表达的区别。另外的一个呢,就是和TCGA联合使用。由于...
GTEx基因表达数据库 Genotype-Tissue Expression(GTEx):GTEx数据库是一个由美国国立卫生研究院(NIH)资助的项目,旨在研究基因型和组织表达之间的关系。 该数据库包含了来自838位生前健康的人类捐献者的DNA数据(包括Whole Genome Sequencing和Whole Exome Sequencing),以及来自近1000个人类个体的17382份RNA-seq数据,这些数...