其原因是,不同的人体组织表达的基因并不相同。GTEx项目,通过收集健康人体的不同组织样本,尝试了解人类不同组织/器官的特异性基因表达。 从本期开始,我们将介绍GTEx数据库。这是一个值得大家深度学习的数据库。GTEx项目,全称Genotype-TissueExpression (基因型-组织表达) ,主要由美国NIH(国立卫生研究院)的公共基金计划...
GTEx(Genotype-Tissue Expression,基因型-组织表达)数据库是一个极具价值和广泛应用的生物医学研究资源,该数据库通过收集健康人体的不同组织样本,深入探索了人类不同组织的特异性基因表达和调节机制。 GTEx项目的背景与目的 GTEx项目由美国国立卫生研究院(NIH)的公共基金计划连续资助了10年(2010-2019),旨在研究人类不同...
疑惑一:什么是GTEx数据库? 答:GTEx全称是Genotype-Tissue Expression,称为基因型组织表达。GTEx首次出现是2013年在Nature Genetics杂志上发表的文章The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project中,该文中首次介绍了Genotype-Tissue Expression,并成立了Genotype-Tissue Expression Consortium。2015年发表在Science上标题为The...
GTEx数据库是什么？GTEx全称为Genotype-Tissue Expression，是基因型组织表达的简称。该数据库于2013年首次在Nature Genetics杂志上发表的文章中提出，其目的是通过收集个体内不同组织的遗传表达变化来检查基因型组织表达。随后在2015年的Science杂志上，对GTEx进行了深入的分析和研究。该数据库收集了来自1641个...
GTEx:基因型和基因表达量关联数据库 GTEx全称如下 Genotype-Tissue Expression 该项目对来自人体多个组合和器官的样本,同时进行了转录组测序和基因分型分析,构建了一个组织特异性的基因表达和调控的数据库。网址如下 https://gtexportal.org/home/ 包含的组织类型和样本个数如下图所示...
大家好，今天来聊聊在生信分析中不可忽视的GTEx数据库。GTEx，全称为Genotype-Tissue Expression，意为基因型组织表达。这个数据库首次在2013年Nature Genetics杂志上发表的文章《The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project》中出现，随后在2015年的Science杂志上发表的《The Genotype-Tissue Expression (...
Genotype-Tissue Expression 该项目对来自人体多个组合和器官的样本,同时进行了转录组测序和基因分型分析,构建了一个组织特异性的基因表达和调控的数据库。网址如下 https://gtexportal.org/home/ 包含的组织类型和样本个数如下图所示 对于所有的样本,主要进行了以下三种分析 ...
GTEx全称如下 Genotype-Tissue Expression 该项目对来自人体多个组合和器官的样本,同时进行了转录组测序和基因分型分析,构建了一个组织特异性的基因表达和调控的数据库。网址如下 https://gtexportal.org/home/ 包含的组织类型和样本个数如下图所示 对于所有的样本,主要进行了以下三种分析 1. RNA... ...
疑惑一:什么是GTEx数据库? 答:GTEx全称是Genotype-Tissue Expression,称为基因型组织表达。GTEx首次出现是2013年在Nature Genetics杂志上发表的文章The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project中,该文中首次介绍了Genotype-Tissue Expression,并成立了Genotype-Tissue Expression Consortium。2015年发表在Science上标题为The...
GTEx项目对来自人体多个组合和器官的样本,同时进行了转录组测序和基因分型分析,构建了一个组织特异性的基因表达和调控的数据库:Genotype-Tissue Expression (GTEx) 1. 背景知识 一期 2015年,GTEx发布了第一个阶段性成果,一次性在Science杂志上发表三篇研究成果,该成果还被选为封面文章。GTEx的研究从175名死者身上采集...