今天给大家介绍的这款工具可以说是一个全能型工具,它就是GSCALite,网址是bioinfo.life.hust.edu.cn。 这个工具由华中科技大学生科院的郭安源教授团队开发,2018年发表在生物信息学专业的国际权威学术期刊《Bioinformatics》。 下面我们就以网页上的栗子给大家介绍如何使用吧,点击“Show me example”,
GSCAlite由来自华中科技大学生命科学院郭安源教授课题组开发,提供了一系列服务来执行基因组学(Expression, SNV, CNV and methylation)和免疫基因组(24个免疫细胞)分析。此外,结合临床信息和小分子药物,用户可以挖掘候选生物标志物和有价值的小药物,以进行更好的实验设计和进一步的临床试验。GSCA整合了来自TCGA的33种癌症...
GSCALite只需要在页⾯输⼊感兴趣的基因集，选择癌症或组织类型以及分析⽅式就可以进⾏在线分析（这⾥以在线⼯具给出的⽰例基因集进⾏演⽰）TCGA Cancer层⾯分析 mRNA Expression：Single Nucleotide Variation：Copy Number Variation：Methylation：Pathyway Activity：miRNA Network：Drug Sensitivity GTEx ...
Here, we present a web server named Gene Set Cancer Analysis (GSCALite) to analyze a set of genes in cancers with the following functional modules. (i) Differential expression in tumor versus normal, and the survival analysis; (ii) Genomic variations and their survival analysis; (iii) Gene ...
GSCAlite由来自华中科技大学生命科学院郭安源教授课题组开发,提供了一系列服务来执行基因组学(Expression, SNV, CNV and m... 03月18日阅读 被查看4,076 次发表评论 阅读全文 热门文章 1推进MASLD和MASH研究:脂肪性肝病代谢功能障碍的工具和策略 2新热点:溶酶体介导(依赖)的细胞死亡 ...