网址: Release notes - GROMACS 2020 documentationmanual.gromacs.org/documentation/2020/release-notes/index.html 主要特色 GROMACS 2020已于2020年1月1日发布。此后可能发布补丁程序,请使用更新的版本。以下列出一些主要特色。 无论是否启用GPU,都进行了一些性能改进,默认情况下全部启用并自动启用。另外,有几个可...
对cmake 参数所做的修改可参见官方文档Installation guide - GROMACS 2024.2 documentation。-DGMX_BLAS_USER 和-DGMX_LAPACK_USER 指向提供了 BLAS 和 LAPACK 的库,libopenblas 提供了这两者。 这里从我自己的需求出发,除 cp2k 外还带了如下特性:GPU加速(CUDA),MPI,单精度,colvars。不需要这些特性、需要双精度...
下载哪个版本视情况而定,目前官网是2022版本,但是还有之前的一些版本 Installation guide — GROMACS 2022.2 documentation 最好是有一定权限的机器才搞这个,最麻烦的就是安装这一步了 tar xfz gromacs-2022.2.tar.gz cd gromacs-2022.2 mkdir build cd build cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST...
Gromacs总共分为以下几栏 About Gromacs Developer Zone//如果要改源码,要读这一部分 Documentation//对gmx有一个深入的了解 Downloads GPU acceleration//从4.6版本开始,用了新的gpu架构,里面有测试的参数 Gromacs papers//初始文献 Jobs//招聘 Project ideas//提出的未来的项目 Support//help,里面有举办的培训班信...
1 首先确保已安装好VMware虚拟机和CentOS操作系统(如下图)。此外可以到Gromacs官网和cmake官网下载安装程序包(http://manual.gromacs.org/documentation/ https://cmake.org/download/)。2 检查和安装C/C++(如下图)检查C/C++:$ gcc -v安装C/C++:$ sudo yum install gcc(这里sudo是获取临时root权限，需要管理...
website athttp://www.gromacs.org/Documentation/Errors --- Abort(1) on node 0 (rank 0 in co...
Cmake和Gromacs程序包——官网下载(Gromacs官网和cmake官网下载安装程序包(http://manual.gromacs.org/documentation/以及https://cmake.org/download/) Gromacs详细安装教程 1、检查和安装C/C++ 检查命令 gcc -v 安装命令 sudo yum installgcc(这里sudo是获取临时root权限,需要管理员密码;另外用"su"命令进行root操...
website athttp://www.gromacs.org/Documentation/Errors 本人刚接触gromacs不久，打算照着gromacs ...
wgethttps://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2023.3.tar.gz Refer to the current source code in theGROMACS documentation. After downloading, extract the GROMACS source code from the tarball. xfz gromacs-2023.3.tar.gz Navigate to the newly extracted GROMACS source directory, create a build d...
跨节点运行可以用openMPI或mpich。安装方法参考了http://www.gromacs.org/Documentation/Installation_...