3 LAMMPS – NVIDIA GPU – WSL 4 AdaptiveCpp – ROCm 4.1 每步命令 5 GROMACS – AMD GPU 5.1 每步命令 5.2 并行性能调优 0 前言 上个月收到一位网友的哔哩哔哩私信,希望笔者帮他折腾一下用AMD GPU跑LAMMPS,笔者本不太愿意接这种“吃力不讨好”的活,拖了一天多,最终良心过不去,还是接了。 该网友的PC...
6. 将需要使用AMD GPU的用户(对于PC,一般是主用户)添加到render组: usermod-a -G render[用户名] 7. 重启: reboot 重启后在需要使用AMD GPU的用户下执行rocminfo,如有正常输出,则说明ROCm软件栈配置完毕。 2 LAMMPS – AMD GPU 在6800XT的PC上编译LAMMPS 2Aug2023,同时包含GPU包和Kokkos包用于GPU加速。使...
cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/jchen/6T/software/gmx2021 -DGMX_GPU=CUDA -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR=/usr/local/cuda -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/agatha/software/gmx2021 -DGMX_GPU=CUDA -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR=/usr/local/cuda-DGMX_BUILD_OWN...
5 GROMACS – AMD GPU5.1 每步命令1. 建立并进入编译所用目录：mkdir build-sycl-rocm复制代码2. C...
鉴于此，笔者为其两台PC分别编译了LAMMPS，并对性能进行了一定的优化。了解到他需要模拟甲烷、二氧化碳等物质在二氧化硅或石墨烯表面的吸附，因此推荐并为其编译了GROMACS 2023.2。在此之前，已有相关软件在AMD GPU平台上的基准测试、兼容性说明和疑难解答文章发布，本文则是一系列文章的补充。安装ROCm软件...
如果你想放在Intel GPU或者AMD GPU上跑,请用这两家显卡对应的编译器重新从源码编译软件。至于显卡硬件状态问题,这种情况对笔记本电脑来说偶有发生(我就遇到过),检查方法是打开设备管理器(win10或win11搜索栏直接搜),看到里面的“显示适配器”图标上面是否有一个黄色三角感叹号图标,如果有就说明这个设备运转不正常。更...
AMD GPU, try gmx mdrun -ntomp 7 -pin on. This will leave free CPU resources for the GPU ...
ubuntu16.04安装nvidia geforce gtx1080ti显卡驱动和cuda10.0用来运行gromacs-gpu 1.走不通的方法 如上图所示,我使用ubuntu自带的软件software&updates的additional drivers栏安装nvidia显卡驱动(nvidia-384,这个驱动并不是最新的驱动), 而且我没有禁用nouveau。如下所示,vmd能够检测到cuda和显卡,nvidia-smi也能检测到驱动...
5 GROMACS – AMD GPU 5.1 每步命令 1. 建立并进入编译所用目录: mkdirbuild-sycl-rocmcdbuild-sycl-rocm 2. CMake配置: cmake -DCMAKE_PREFIX_PATH=/opt/AdaptiveCppDev20231011.rocm570 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/gmx2023.2_sycldev20231011_rocm570_gfx1030 -DCMAKE_C_COMPILER=/opt/rocm/llvm/bin...
如果你想放在Intel GPU或者AMD GPU上跑,请用这两家显卡对应的编译器重新从源码编译软件。至于显卡硬件状态问题,这种情况对笔记本电脑来说偶有发生(我就遇到过),检查方法是打开设备管理器(win10或win11搜索栏直接搜),看到里面的“显示适配器”图标上面是否有一个黄色三角感叹号图标,如果有就说明这个设备运转不正常。更...