3 LAMMPS – NVIDIA GPU – WSL 4 AdaptiveCpp – ROCm 4.1 每步命令 5 GROMACS – AMD GPU 5.1 每步命令 5.2 并行性能调优 0 前言 上个月收到一位网友的哔哩哔哩私信,希望笔者帮他折腾一下用AMD GPU跑LAMMPS,笔者本不太愿意接这种“吃力不讨好”的活,拖了一天多,最终良心过不去,还是接了。 该网友的PC...
5. 安装ROCm软件栈，含AMD GPU内核态驱动：amdgpu-install --usecase=rocm,hiplibsdk 复制代码 此前...
6. 将需要使用AMD GPU的用户(对于PC,一般是主用户)添加到render组: usermod-a -G render[用户名] 7. 重启: reboot 重启后在需要使用AMD GPU的用户下执行rocminfo,如有正常输出,则说明ROCm软件栈配置完毕。 2 LAMMPS – AMD GPU 在6800XT的PC上编译LAMMPS 2Aug2023,同时包含GPU包和Kokkos包用于GPU加速。使...
对于GROMACS在AMD GPU上的编译和使用，编译命令与LAMMPS类似，配置时注意调整并行参数。性能优化方面，可参考之前关于并行性能调优的经验。通过mdrun命令设定并行参数，无需额外添加环境变量，运行前确保OpenMP环境变量已被unset，以实现最佳性能。
AMD GPU, try gmx mdrun -ntomp 7 -pin on. This will leave free CPU resources for the GPU ...
Required drivers To use the AMD CPUs on HBv3-series VMs, you need to install AMD drivers. To use InfiniBand, you need to enable InfiniBand drivers. GROMACS installation Install GROMACS on a virtual machine Before you install GROMACS, you need to deploy and connect a Linux VM and install the...
如果你想放在Intel GPU或者AMD GPU上跑,请用这两家显卡对应的编译器重新从源码编译软件。至于显卡硬件状态问题,这种情况对笔记本电脑来说偶有发生(我就遇到过),检查方法是打开设备管理器(win10或win11搜索栏直接搜),看到里面的“显示适配器”图标上面是否有一个黄色三角感叹号图标,如果有就说明这个设备运转不正常。更...
ubuntu16.04安装nvidia geforce gtx1080ti显卡驱动和cuda10.0用来运行gromacs-gpu 1.走不通的方法 如上图所示,我使用ubuntu自带的软件software&updates的additional drivers栏安装nvidia显卡驱动(nvidia-384,这个驱动并不是最新的驱动), 而且我没有禁用nouveau。如下所示,vmd能够检测到cuda和显卡,nvidia-smi也能检测到驱动...
Required drivers To use the AMD CPUs on HBv3-series VMs, you need to install AMD drivers. To use InfiniBand, you need to enable InfiniBand drivers. GROMACS installation Install GROMACS on a virtual machine Before you install GROMACS, you need to deploy and connect a Linux VM and install the...
5 GROMACS – AMD GPU 5.1 每步命令 1. 建立并进入编译所用目录: mkdirbuild-sycl-rocmcdbuild-sycl-rocm 2. CMake配置: cmake -DCMAKE_PREFIX_PATH=/opt/AdaptiveCppDev20231011.rocm570 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/gmx2023.2_sycldev20231011_rocm570_gfx1030 -DCMAKE_C_COMPILER=/opt/rocm/llvm/bin...