9) 安装gromacs 一键安装版: old version sudo apt install gromacs 2025 version: /home/zj/software/gromacs-2025.0/myinstall export CMAKE_PREFIX_PATH=/home/zj/software/fftw-3.3.10/myinstall/bin cd myinstall/ cmake -DGMX_NVCC_WORKS=ON .. cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_D...
第一步:安装gcc sudo apt-get install gcc 第二步:安装cmake sudo apt-get install cmake 第三步:安装openmpi和fftw3(设定支持MPI) http://www.fftw.org/download.html wget ftp://ftp.fftw.org/pub/fftw/fftw-3.3.10.tar.gz tar xvf fftw-3.3.10.tar.gz cd fftw-3.3.10 ./configure --enable...
5.测试安装是否成功 打开命令行(或者按键wins+R)输入cmd,输入gmx -version 成功,暂时Over Linux系统Gromacs安装 在上一讲中我们使用了虚拟机建立了Linux22.04系统,在此基础上安装gmx2022.5版本 下载Gromacs文件 搜索gromacs 点击Welcome to GROMACS 点Downloads,选择2022.5下载 选https后面的链接 2.安装支持程序(感谢药...
GROMACS是免费开源的分子动力学软件,目前最新版本是2022.1。 1. 服务器选择 根据需要选择GPU服务器,在配置时选择后台安装CUDA驱动,建议选择较新版本驱动及CUDA,对GROMACS-2022而言,需要CUDA版本大于11.0。官网说明11.3可能安装有问题,未测试;已测试11.0及11.4安装GROMACS2022.1可成功。按以下操作在Ubuntu或CentOS操作系统中...
Cmake和Gromacs程序包——官网下载(Gromacs官网和cmake官网下载安装程序包(http://manual.gromacs.org/documentation/以及https://cmake.org/download/) Gromacs详细安装教程 1、检查和安装C/C++ 检查命令 gcc -v 安装命令 sudo yum installgcc(这里sudo是获取临时root权限,需要管理员密码;另外用"su"命令进行root操...
GROMACS在Windows系统上的安装可以通过下载预编译的Windows-GPU版GROMACS包,并按照步骤进行配置。 要在Windows系统上安装GROMACS,可以按照以下步骤进行: 查看显卡支持的CUDA版本: 打开命令行(按Win + R,输入cmd),然后输入nvidia-smi查看显卡支持的CUDA版本。 也可以通过NVIDIA控制面板查看支持的显卡型号,然后到NVIDIA官网查...
声明:编译安装过程使用系统为 centos7,服务器编译环境及硬件配置:cmake 3.29.6/gcc 9.3.1/cuda 12.4/openmpi 5.0.1/fftw为 gromacs 自行安装(CPU使用了fftw-3.3.8版本,GPU使用了cuFFT)/两颗Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2699 v3 @ 2.30GHz/NVIDIA GeForce RTX 4060 Ti/64GB 内存。值得一提的是,root用户最...
4.1 安装GPU加速版Gromacs2023.14.1基础库文件的安装Centos stream 9系统的cmake, gcc 和g++对于...
安装GROMACS 1、编译器最低要求 GNU (gcc) 5.1 CMake 3.9.6 2、安装GCC-7.3 # yum install -y gcc gcc-c++ gcc-gfortran texinfo # wget http://mirrors.ustc.edu.cn/gnu/gcc/gcc-7.3.0/gcc-7.3.0.tar.gz# tar zxvf gcc-7.3.0.tar.gz...