之后,教程指导用户在Google Colab上安装所需的软件包,并详细介绍如何使用AutoDock Vina进行对接模拟。分子对接的核心步骤是确定配体与蛋白质的结合位点,并计算其相互作用的能量。AutoDock Vina 是一种高效的工具,能够通过计算机模拟快速预测小分子如何与蛋白质结合,广泛应用于药物筛选和设计中。视频通过实际操作展示了如何...
This streamlined environment enables users to visualize docking structures with just one click. The code is available under a CC-BY NC 4.0 license from https://github.com/ohuelab/MEGADOCK-on-Colab.doi:10.1186/s13104-023-06505-wOhue, Masahito...
视频中的操作基于Google Colab的云计算环境,帮助用户在网络浏览器中运行对接程序。视频从基础开始,首先讲解如何准备蛋白质和配体文件,这是分子对接中的关键步骤。配体是与蛋白质结合的小分子,而蛋白质则是作为受体的分子。视频展示了如何使用开放的数据库如PDB(Protein Data Bank)来获取这些文件,并在PyMOL等可视化工具...
视频中的操作基于Google Colab的云计算环境,帮助用户在网络浏览器中运行对接程序。 视频从基础开始,首先讲解如何准备蛋白质和配体文件,这是分子对接中的关键步骤。配体是与蛋白质结合的小分子,而蛋白质则是作为受体的分子。视频展示了如何使用开放的数据库如PDB(Protein Data Bank)来获取这些文件,并在PyMOL等可视化...