3. 绘制条形图 现在,你可以使用R语言的绘图功能绘制三合一双侧条形图,展示bp、mf和cc的GO分析结果。 #代码示例```R#安装绘图包install.packages("ggplot2") library(ggplot2)#绘制条形图ggplot(bp_data, aes(x = GO_term, y = FDR, fill = Category)) + geom_bar(stat = "identity", position = "d...
1,打开绘图页面 首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开GO BP、CC、MF三合一双侧条形图绘制页面,左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_GO_term_bp_cc_mf_left_right_bar_plot_191 图1.可视化页面 2,示例数据 点击右侧“示例...
数据集数据集GSE35257和GSE121190中具有下调功能的差异表达基因 实验组和正常组差异表达基因的火山图 GO分析的BP、CC、MF三合一条形图 肾纤维化中差异表达基因的富集点气泡 肾纤维化中的差异表达基因的水平条形图 差异表达基因建立的PPI网络图 10个中心基因的相互作用图...
它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差异的基因富集到某个通路中进而了解其作用和功能。GO...
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开GO BP、CC、MF三合一双侧条形图绘制页面,左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_GO_term_bp_cc_mf_left_right_bar_plot_191
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。 上面这张figure分了四张柱形图来分别展示BP,CC,MF和...
评论 还没有人评论过,快来抢首评 发布 GO BP,CC,MF,KEGG pathway富集结果上调和下调放一起的点线图 微生信 发布于:上海市 2023.09.28 14:42 +1 首赞 收藏 使用不同的颜色条,加上分面,将GO,KEGG富集分析上调和下调结果整合在一张图中。 推荐视频 已经到底了 热门视频 已经到底了 ...
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。
微生信 0代码在线绘制200+款科研图,助力做ppt,发文章关注GO BP,CC,MF,KEGG pathway富集结果上调和下调放一起的点线图发布于 2023-09-28 14:19・IP 属地上海 · 9 次播放 赞同1添加评论 分享收藏喜欢 举报 富集分析科研绘图在线绘图KEGG...
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。