python UniProt2GO_annotate.py idmapping.tb.gz blastout outputfile 结果如下: c93619_g2_i1GO:0005506,GO:0016705,GO:0016021,GO:0004497,GO:0020037 c93619_g2_i3GO:0009733,GO:0020037,GO:0044550,GO:0016021,GO:0016020,GO:0016711,GO:0009813,GO:0005789,GO:0005506 c70056_g1_i1GO:0005737,GO:00...
文件1:GO_ids 文件 格式如下 gene136870 GO:0006950,GO:0005737 gene143400 0006468,GO:0005737,GO:0004674,GO:0006914,GO:0016021,GO:0015031,GO:0004714 gene144020 GO:0006941,GO:0005524,GO:0003774,GO:0005516,GO:0005737,GO:0005863 gene000620 GO:0006350,GO:0006355,GO:0007275,GO:0030528 gene144530 GO:...
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$ENSG00000000005 [1]"GO:0016021""GO:0005737""GO:0005515""GO:0005635""GO:0016525" [6]"GO:0001886""GO:0001937""GO:0071773""GO:0035990" 二,构建基因列表:geneList 1 2 3 4 5 6 7 8 diff=read.table("./gene_exp.diff",sep="t",header=TRUE) # 差异表达基因 interesting_genes=factor(diff...
所谓的 GO，是⽣物学功能注释的⼀个标准词汇表术语（GO term），将基因的功能分为三部分：基因执⾏的分⼦功能（Molecular Function）基因所处的细胞组分（Cellular Component）基因以及参与的⽣物学过程（Biological Process）不同的 GO term 通过有向⽆环图关联起来，如下图所⽰：可以看出，不同的 GO ...
c66585_g1_i1 GO:0005737,GO:0003746,GO:0003924,GO:0005525 c110618_g1_i8 GO:0015297,GO:0016021,GO:0015238 c105249_g1_i5 GO:0046872,GO:0043161,GO:0005829,GO:0006915,GO:0032648,GO:0050691,GO:0005654,GO:0070936,GO:0061630,GO:0005634 ...
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基因本体论定义与基因功能有关的概念（'GO术语'），以及这些功能如何相互关联。随着生物学知识的积累，它...
6TASbiological_process7IEAcellular_component8TASbiological_process>head(geneID2GO)$ENSG00000000003[1]"GO:0004871""GO:0005515""GO:0005887""GO:0070062""GO:0007166"[6]"GO:0043123""GO:0039532""GO:1901223"$ENSG00000000005[1]"GO:0016021""GO:0005737""GO:0005515""GO:0005635""GO:0016525"[6]"GO:...
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