GO富集分析主要涉及三个分支:生物过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cellular Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)。下面将详细解释这三个分支在GO富集分析中的含义、应用方法,并提供相关的分析步骤、工具推荐及注意事项。 一、BP、CC、MF在GO富集分析中的含义 生物过程(BP): 描述生物学上发生的...
基于DAVID富集分析结果,零代码在一张图里面用柱状图展示GO的BP,MF和CC的富集结果, 视频播放量 591、弹幕量 0、点赞数 12、投硬币枚数 0、收藏人数 21、转发人数 0, 视频作者 生信交流平台, 作者简介 生信博士,分享生信技能。合作请联系:,相关视频:单基因GO+KEGG富集分
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。
1,打开绘图页面 首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开GO BP、CC、MF三合一双侧条形图绘制页面,左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_GO_term_bp_cc_mf_left_right_bar_plot_191 展开剩余77% 评论 全部 还没有人评论过,快...
零代码GO富集分析—一张图展示BP,MF,CCmp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=2649220439&idx=1&sn=b106daaf126e028a186abd64883b2143&chksm=f3d1af22c4a62634c87a2cc50ae32068bd6f8713878e9dcd6dc9a80fe598b90309c14b0027c0&payreadticket=HL_mzM1VKuIMKNTUTWKuDJG119bKqCZPJ-9Ftv...
导读:棒棒糖图展示GO富集分析结果。每个GO术语用一根竖线表示,竖线的高度为-log10(p),表示统计显著性。圆圈中的数字表示注释到特定GO术语的差异表达基因的个数。圆圈的颜色表示GO的3个类别:BP,CC,MF。 GO本…
如下图所示,在功能富集分析的结果中有多个折叠栏,其中Gene_Ontology (3 selected)这一折叠栏中有三个栏目(蓝框):GOTERM_BP_FAT、 GOTERM_CC_FAT、 GOTERM_MF_FAT就是是我们想要的GO功能富集分析结果。而Pathways (3 selected)里面有一个KEGG_PATHWAY(蓝框)就是我们想要的结果。如何找到BP、CC、MF和KEGG对应...
GO分析分为3部分,分别是生物过程(Biological Process,BP),细胞组成(Cellular Component,CC)分子功能(Molecular Function,MF)。GO分析可以通过数据于DAVID数据库工具即可,操作步骤为输入数据,选择种属,选择聚类,下载数据即可。 得到的数据如下,以下所有实例都是用这些数据进行演示。
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。
各位医学方的朋友,大家好。今天我们聊一聊富集分析,说到富集分析,你会想到KEGG或者GO富集分析,GO实际上是GeneOntology两个单词的首字母简写,主要包括BP,MF,CC三个部分,分别代表的是生物学过程,分子功能和细胞定位。富集分析结果展示的时候,我们一般会画气泡图或者条形图,如下: ...