构建基础经典分子网络（CMN）：仅基于碎片光谱的相似性进行构建。特征网络（FBMN）：不仅考虑碎片光谱，还...
在GNPS（全球天然产物社会分子网络）平台上，CMN（经典分子网络）和FBMN（基于特征的分子网络）是两种用于...
其中,FBMN(Feature Based Molecular Networking)是GNPS中的一种操作流程,用于将质谱数据进行特征提取,并通过网络图谱的方式展示不同样本之间的相似性和差异性。本文将详细介绍FBMN操作流程的步骤和原理。 一、数据预处理 在进行FBMN操作之前,首先需要对原始质谱数据进行预处理。这一步骤主要包括峰提取、去噪、归一化和...
请参阅由 MS-DIAL 生成的文件并通过导出工作流程用于 FBMN 的示例。 3. Running the FBMN with MS-DIAL 3. 使用 MS-DIAL 运行 FBMN¶ After the processing with MS-DIAL, the output files can be used to run the Feature-Based Molecular Networking workflow on GNPS either using the [Superquick ...
yanayn88 新虫 (正式写手) 应助: 0 (幼儿园) 金币: 1166.1 帖子: 824 在线: 14.4小时 虫号: 26468390 注册: 2021-05-24 性别: MM 专业: 中药药效物质 楼主找到答案了吗 发自小木虫Android客户端 赞一下 回复此楼 2楼2022-10-19 09:07:47 已阅 回复此楼 关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回...
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基于FBMN的GNPS分析 02 知识重点(文献背景) u 分子网络技术对二级质谱进行相似性分析构建分子网络,目前GNPS是OA的质谱数据处理平台,能够对分子结构进行可视化和结构注释,包括Classic MN,featurenetworking u关键技术问题: Classic MN: ① 采用MS-Cluster algorithm对二级质谱进行分析,数据利用度不高【能利 用DDA数据,对...
u classical MN method 运行完全在 GNPS platform, 通过MS-Cluster 聚类生成MN u FBMN:① 通过对质谱数据进行特征提 取和峰对齐(MZmine,MS-DIAL,XCMS, OpenMS,Progenesis QIorMetaboScape) ②导出feature quantification table (.TXT format) and MS2 spectral summary (.MGF ...
- FBMN特征网络：FBMN能够区分同分异构体，并利用注释信息。此外，它还包含相对定量信息，这对于深入...
yanayn88 新虫 (正式写手) 应助: 0 (幼儿园) 金币: 1166.1 帖子: 824 在线: 14.4小时 虫号: 26468390 注册: 2021-05-24 性别: MM 专业: 中药药效物质 楼主找到答案了吗 发自小木虫Android客户端 赞一下 回复此楼 高级回复 2楼2022-10-19 09:07:47 已阅 回复此楼 关注TA 给TA发消息 送TA红...