gmx_mmpbsa使用说明jerkwin.github.io/2019/07/31/gmx_mmpbsa%E4%BD%BF%E7%94%A8%E8%AF%B4%E6%98%8E/ 下面的内容主要参考gmx_mmpbsa的官方教程: Installation - gmx_MMPBSA Documentationvaldes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/dev/installation/ 快速安装 本人操作系统为Win10+Ubuntu wsl 20.04。
gmx_MMPBSA是基于AMBER MMPBSA.py用于计算终态自由能(gmx格式文件)的工具 只翻译部分内容,具体可参考官方文档殷赋科技:【分子动力学教程】结合自由能计算(MM/PB(GB)SA)https://valdes-tresanco-ms.github.io/g…
应读者要求,我们今天就来介绍如何使用gmx_MMPBSA程序为GROMACS动力学轨迹计算MM/PBSA结合自由能。 值得一提的是,殷赋云平台(https://cloud.yinfotek.com)早已上线Amber分子动力学与结合自由能计算方案,今年下半年将会上线GROMACS版本的计算方案。...
另外，我在官方教程上看到需要的准备文件包括很多结构文件 这里的mol2文件是必须文件，且必须要用[color=...
http://www.mdtutorials.com/gmx/complex/06_equil.html官方教程里面有教怎么加，蛋白质的限制文件在...
把gmx_MMPBSA当成一个python包用conda装就好了，官网的安装教程也提示了用conda装能省去一些步骤 https:...