gmxdensity- 计算体系的密度 gmxdensmap- 计算二维的平面或轴径向密度映射图 gmxdensorder- 计算表面涨落 gmxh2order- 计算水分子的取向 gmxhydorder- 计算给定原子周围的四面体参数 gmxorder- 计算碳末端每个原子的序参量 gmxpotential- 计算盒子内的静电势 3.4 协方差分析 gmxanaeig- 分析简正模式 gmxcovar- 计算...
先用gmx_mpi densmap -f step5.xtc -s step5.tpr -n index.ndx -o densmap.xpm -b 30000 -...
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