remotes::install_github("willtownes/glmpca") Usage library(glmpca) #create a simple dataset with two clusters mu<-rep(c(.5,3),each=10) mu<-matrix(exp(rnorm(100*20)),nrow=100) mu[,1:10]<-mu[,1:10]*exp(rnorm(100)) clust<-rep(c("red","black"),each=10) Y<-matrix(rpois(...
Even in the cases where non-parametric methods fail to distinguish genotype × environment (G × E) interaction, a generalization of PCA to exponential family likelihoods (GLM-PCA) can detect informative locations and phenotypically stable resistant genotypes. In this study, 35 elite wheat genotypes...
请问为什么三个pca成分成为作为pca协变量控制群体结构对GWAS关联准确性的影响进行GLM和LLM时,识别到四个...
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