在GWAS中,GLM常用于进行单一SNP的关联分析,即将每个SNP作为一个独立的解释变量与表型进行关联。 MLM(Mixed Linear Model):混合线性模型是在GWAS中用于控制种族结构和家族关系等潜在的混杂效应的常用方法。MLM通过引入随机效应(例如,基因型矩阵的协方差结构)来捕捉样本之间的相关性,以降低虚假关联(false positives)的产生...
亲您好,很荣幸为您解答:2.1 GLM:一般线性模型-fork1 vcf文件 Troot.vcf-fork2 表型数据文件 trait.txt-fork3 群体结构Q文件 Q.txtvim glm.shperl run_pipeline.pl -Xmx10g -Xms512m -fork1 -vcf Troot.vcf -fork2 -r trait.txt -fork3 -q Q.txt -excludeLastTrait -combine4 -inp...
源码地址:GLM-4/finetune_demo/inference.py at main · THUDM/GLM-4 · GitHub 实现代码 # MLM之GLM-4:GLM-4-9B源码解读(inference.py)加载预训练的因果语言模型基于用户提问实现对话生成——定义对话消息模板{system+tools+user}→加载模型和分词器→利用apply_chat_template函数应用对话模板(将消息转换为模型...
大部分是混合模型,GLM也差不多的话说明亲缘关系不强;
源码地址:GLM-4/finetune_demo at main · THUDM/GLM-4 · GitHub 实现代码 # -*- coding: utf-8 -*- # MLM之GLM-4:GLM-4-9B源码解读(finetune.py)模型微调与评估的完整实现——定义命令行参数→加载微调配置/模型/分词器/数据管理器→定义数据集(训练集/验证集/测试集)→模型训练(梯度检查点/支持...