[1] ggpubr_0.4.0 ggplot2_3.3.2 loaded via a namespace (and not attached): [1] zip_2.0.4 Rcpp_1.0.3 cellranger_1.1.0 pillar_1.4.6 compiler_3.6.1 forcats_0.5.0 [7] tools_3.6.1 digest_0.6.27 lifecycle_0.2.0 tibble_3.0.4 gtable_0.3.0 pkgconfig_2.0.3 [13] rlang_0.4...
接下来，我们将探讨另一种常用的图表——小提琴图。在ggpubr包中，箱式图对应的函数是ggboxplot，而小提琴图则使用ggviolin函数来绘制。在绘制小提琴图的基础上，我们进一步叠加了箱式图，以更全面地展示数据分布。其余设置与之前的图表基本保持一致，仅需稍作调整。以下是相关代码示例：ggviolin(Typex ~ GeneExp,...
ggpubr包极简绘制出版物标准的图形, 视频播放量 783、弹幕量 0、点赞数 43、投硬币枚数 16、收藏人数 91、转发人数 10, 视频作者 五柳冰冰, 作者简介 R包最全分享者!跟踪R官网上最新R包的发布信息,精炼讲解其功能,通俗易懂。,相关视频:1.新版ggplot2-3.4.2精讲——基
首先我们载入R包还有数据集: #install.packages("ggpubr")#这里注意的是 我们要首先载入ggplot2,在载入ggpubr包library(ggplot2)library(ggpubr)# ToothGrowth数据集data("ToothGrowth")head(ToothGrowth) 接下来是# mtcars 数据集data("mtcars")mtcars$name<-rownames(mtcars)mtcars$cyl<-as.factor(mtcars$cyl)...
探索R语言的ggpubr包：快速创建SCI级散点图 R语言的ggpubr包功能丰富，操作相对简便，相较于ggplot，其使用门槛更低。该包提供了十余种函数，能够绘制出约30种不同类型的图形。本次，我们将深入探讨如何利用R语言的ggpubr包来绘制符合SCI发表标准的散点图。为了实践这一目标，我们将以R自带的数据集mtcars为例...
甜甜圈图是展示百分比数据的不错选择,之前已经介绍过2期(R语言绘图—甜甜圈图;R语言绘图—甜甜圈图(2)),今天再为大家介绍甜甜圈图的另外一种绘法—ggpubr版的甜甜圈图的绘制法。 原文见:R语言绘图—ggpubr版的甜甜圈图 一、数据模拟 这里模拟的数据使用往期推文数据: ...
今天我们要分享的R包是 ggpubr 包,它是一款基于ggplot2的可视化包,功能非常强大,能够一行命令绘制出符合出版物要求的图形。ggpubr 包可绘制的图形类型非常多,有密度图、直方图、柱状图、饼图、棒棒糖图、Cleveland 点图、箱线图、小提琴图、点带图、点图、散点图、线...
ggpubr-专为学术绘图而生 由Hadley Wickham创建的ggplot2(https://ggplot2.tidyverse.org/)非常好用的可视化包了,但是由ggplot2绘制的图形通常不能直接用于发表,还需要经过一定程度的编辑,对于不少那么会编程的研究人员而言可能并不是特别友好。 因此,ggpubr应运而生,它提供了简单易用的函数,用于绘制定制的高质量...
1.2 添加p值与ggplot2绘图相似，直接在图上显示。1.3 去掉上方的图例，直接添加X轴标注。2. 组合多张小提琴图，先分别绘制每张图，然后使用ggpubr包的ggarrange函数进行组合，可根据需求自行调整美化。3. 直接绘制多张小提琴图于一张图，需要先调整数据结构为长矩阵形式，基因、基因表达值与生存状态...
R绘图：配对样本差异表达作图ggpubr 公众号：生信小课堂 现实中有很多数据都是配对的，最常见的就是癌和癌旁，ggpubr包的ggpaired函数可以实现配对样本的统计和作图 加载数据 rm(list = ls())library(tidyverse)library(ggpubr)pairdata<-read.table('pair.txt',header = T,sep = '\t')ggpaired用法 ggpaire...