R语言可视化--CMplot、ggplot2绘制GWAS结果manhatan曼哈顿图(标注基因名称、阈值线)-公众号数据分析的取经之路可获得本期代码哦~ 507 -- 5:30 App R语言可视化之利用ggplot2画小提琴图、箱线图、散点图组合图 公众号数据分析的取经之路可获得本期视频代码及示例数据哦~ 104 -- 11:55 App R语言可视化|利用ggpl...
R语言可视化之利用ggplot2绘制箱线图+散点图+配对连线+标注差异显著性, 视频播放量 962、弹幕量 0、点赞数 13、投硬币枚数 8、收藏人数 43、转发人数 3, 视频作者 数据分析取经之路, 作者简介 内心丰盈者,独行也如众。,相关视频:R语言可视化之利用ggplot2绘制拟合平滑折
p+geom_boxplot()+geom_jitter(width = 0.2, alpha = 0.5, color = 'red') jitter可以理解为抖动,将散点打散,让我们能观察到点的集中与分散的分布状况。 上图中,箱子和黑色点为箱线图的元素,红色的散点则为原始数据的散点图元素,按层堆叠在一起,构成这样一幅有层次感的“带散点的箱线图”。 4.面板...
散点图作图代码 dat02<-read_excel("data/20220711/41586_2022_4808_MOESM8_ESM.xlsx", sheet = "Fig4d", skip = 1) dat02 library(paletteer) library(latex2exp) ggplot(data=dat02,aes(x=accuracy_snp,y=accuracy_sv))+ geom_point(aes(color=h2_snp))+ scale_x_continuous(limits = c(0,0.5...
散点图可以用来描述两个连续变量之间的关系,一般在做数据探索分析时会使用到,通过散点图发现变量之间的相关性强度、是否线性关系等。 绘制简单的散点图 ggplot包中的geom_point()函数可以非常方便绘制出所需的散点图。 library(ggplot2) set.seed(1234) ...
1)使用半透明的点 2)数据分箱,并用矩形表示 3)数据分箱,并用六边形表示 4)使用二维密度估计,并将等高线添加到散点图中 5)向散点图中添加边际地毯 set.seed(1234) x <- rnorm(10000) y <- rnorm(10000,0,2) df <- data.frame(x = x, y = y) ...
拓展散点图 -- 添加辅助线 添加斜线 添加水平/垂直线 拓展散点图 -- 添加线性回归线以及置信区间 拓展散点图 -- 添加回归曲线的方程式以及决定系数 拓展散点图 -- 添加方差分析表 拓展散点图 -- 添加相关性系数以及显著性 拓展散点图 -- 添加附图 -- 箱线图 ...
# ## (1)使用半透明的点; # ## (2)将数据分箱(bin),并用矩形表示(适用于量化分析); # ## (3)将数据分箱(bin),并用六边形表示; # ## (4)使用箱线图 sp <- ggplot(diamonds,aes(x=carat,y=price)) sp + geom_point() # 设定alpha参数可以使数据点半透明。通过设定alpha=.1和alpha=.01使...
3.箱线图与抖动图 加上散点则可以更好的体现样品数,点越多,结果的稳定性、可靠性越好。 ggplot(data=ToothGrowth)+geom_boxplot(aes(x=supp,y=len))+geom_jitter(aes(x=supp,y=len)) boxplot.png 散点分组 当散点图也需要分组时,如果直接添加fill 和 color 就不够了,ggplot2 函数会分组混乱。
箱线图示例数据集 image.png 作图代码 library(readxl)dat01<-read_excel("data/20220711/41586_2022_4808_MOESM8_ESM.xlsx",sheet="Fig4e",skip=1)dat01library(ggplot2)dat01$Type<-factor(dat01$Type,levels=c("SNP","InDel","SV","SV array"))ggplot(data=dat01,aes(x=Type,y=Accuracy))+geom...