geom_violin(alpha=0.5,aes(linetype=NA))+ xlab("Group")+ylab("Score")+ theme_bw()+theme(legend.position = "none") 通过geom_jitter组合geom_violin可绘制出抖点+小提琴图: ggplot(data2,aes(x=variable,y=value ,fill = variable))+ geom_violin(alpha=0.5,aes(linetype=NA))+ geom_jitter(sh...
p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
绘制小提琴图 绘图使用ggplot函数,依次进行:设置数据文件、初始化坐标轴、绘制小提琴图geom_violin、设置x轴标签显示方式、调整图例摆放位置,然后输入p生成plot。 p <- ggplot(long_table,aes(x=Grp,y=Value)) +geom_violin(aes(fill <- factor(Grp))) +theme(axis.text.x=element_text(angle=45,hjust=1,...
• Key function: geom_violin()• Alternative function: stat_ydensity()• Key arguments to customize the plot: alpha, color, linetype, size and fill.#基础e+ geom_violin()#旋转e+ geom_violin() + coord_flip()#不修剪小提琴的尾部e+ geom_violin(trim = FALSE, fill = "steelblue")加...
geom_violin(linetype = "dashed",na.rm = T)+ stat_boxplot(geom = "errorbar",size = 1,width = 0.3,na.rm = T,linetype = 2)+ geom_boxplot(linetype = 2,na.rm = T,outlier.alpha = 0.3,outlier.size = 3,notch = T,width = 0.3) +#设置箱式图的宽度,避免和小提琴图重合。
这样的话论文中的图就复现出来了。上图叠加的散点图是矩形的,最近看到一个函数geom_sina()可以让散点图也以小提琴的形状显示,我们试一下用这个函数的效果,这个函数来自ggforce这个包,使用前需要先加载 代码语言:javascript 复制 library(ggforce)ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill...
ggplot()+geom_violin(data=, aes(x=, y=))+geom_boxplot(data=, aes(x=, y=), width=, position = position_dodge()) 其实就是小提琴图和箱线图的联用,并要主要控制箱线图的宽度 4. 添加中位数点和SD bar require(hmisc) ggplot(kk, aes(x = cluster, y = nCount_RNA)) + geom_violin...
一、小提琴图 代码语言:javascript 复制 #小提琴图ggplot(data=ToothGrowth,aes(x=supp,y=len,fill=supp))+geom_violin()ToothGrowth$dose<-as.factor(ToothGrowth$dose)ggplot(data=ToothGrowth,aes(x=supp:dose,y=len,fill=supp))+geom_violin()#小提琴图+箱线图ggplot(data=ToothGrowth,aes(x=supp:dose,y...
上述代码中,我们使用ggplot函数创建了一个ggplot2对象,并指定了数据和映射关系。然后,我们使用geom_violin函数绘制了小提琴图。通过设置x和y参数来指定横轴和纵轴的变量,通过fill参数指定小提琴的填充颜色。 美化小提琴图 小提琴图可以通过调整各种参数来使其更美观、易读。下面是一些常见的美化操作。
要使用 ggplot2 包绘制小提琴图,我们使用 geom_violin() 函数。 语法:ggplot(dataframe, aes(x, y, fill, color)) + geom_violin() 参数: dataframe:确定绘图中使用的数据集。 填充:确定绘图内部背景的颜色。 color:决定绘图边界的颜色。 创建基本的小提琴图 这里是使用 geom_violin() 函数制作的基本小提琴...