更改默认的配色和点的大小 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 library(readxl)dat01<-read_excel("example_data/08-heatmap/03_heatmap_example.xlsx")head(dat01) 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 ## # A tibble: 6 x 3
geom_tile()用于创建方块图形,fill参数由value决定,表示每个方块的颜色。 步骤4:自定义热图的配色 为了使热图更加美观和易于解释,我们可以自定义配色。 # 自定义配色heatmap_plot<-heatmap_plot+scale_fill_gradient(low="blue",high="red")+# 配色从蓝色到红色渐变labs(title="Heatmap of Random Data",x="V...
我们主要使用complexheatmap来学习作者这个图中热图的复现。 复现代码 #热图配色方案 heatmap_colors <- colorRamp2(c(0, 0.5, 1), c("#481e5f", "#1e8392", "#f5eb28")) # Figure A # 分组数据 Group=data.frame(Immunotype=sample(c("G1", "G2", "G3", "G4", "G5"), 50, replace ...
实际上，之前heatmap已经足够了，但是ggplot2画图可以进行一些特殊的个性化修饰，一些比较特殊的热图也是通过...
head(map) table(exp$ROI.name %in% map$ROI.name)#ROI.name需要完全匹配 #数据融合: merge<- ggPlantmap.merge(map, exp, 'ROI.name') head(merge) #生成热图: ggPlantmap.heatmap(merge, AT5G47670.expression) #自定义配色与主题: P1<- ggPlantmap.heatmap(merge, AT5G47670.expression) + ...
ggheatmap <- ggplot(lower_tri_melt, aes(Var1, Var2, fill=value))+ geom_tile(color="white")+ scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white", midpoint = 0, limit=c(-1, 1), space = "Lab", name="Person\nCorrelation")+ theme_minimal()+ theme(axis.text....
break是按照给定数值进行切分。...下一步,我们继续设置图例颜色与顺序。...我们来找一下对应颜色语言配色方案: Colors in R。 1.1K40 使用ComplexHeatmap绘制3D热图 在这里,区间中的频度使用热图进行可视化。那么现在,频度热图被称作是密度热图的histogram版本,但这看起来一点都不像histogram。那么可能一个3D的热图...
今天在找R shiny的教程的时候发现了一幅比较漂亮的散点图,配色很好看,代码记录在这里。 先贴出结果图,就是这样式的! image.png 原文地址 https://www.r-bloggers.com/r-shiny-vs-tableau-3-business-application-examples/ 作图代码 构造数据 代码语言:javascript ...
编者按:数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功底,能否达意是最基本的要求---最合适的图示和配色表达最直观的含义。长文多图预警,这是关于ggplot2使用的极详细教程(190+图),是入门和晋级参考的不二手册。 前面部分是关于qplot的使用,后面是ggplot2图层的使用。原文使用R自带数据...
ggheatmap <- ggplot(lower_tri_melt, aes(Var1, Var2, fill=value))+ geom_tile(color="white")+ scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white", midpoint = 0, limit=c(-1, 1), space = "Lab", name="Person\nCorrelation")+ theme_minimal()+ theme(axis.text....