百度定义：箱形图（Box-plot）又称为盒须图、盒式图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料...
如何仅获取十进制格式的pvalueEN下面是去年实习生的分享 EnhancedVolcano包可根据差异分析结果，基于ggplot2...
stat.test %>% add_xy_position(x = "dose", dodge = 0.8) # 确定第二个统计量的位置 stat.test2 <- stat.test2 %>% add_xy_position(x = "dose") # 与boxplot 融合 bxp + stat_pvalue_manual(stat.test,lable = "p") + stat_pvalue_manual(stat.test2,label = "p.adj.signif",tip....
boxplot,自带四分位信息,最好加上jitter让人看到你的数据点 violin plot,在单细胞里很火,可以直接看到数据的分布,可以叠加boxplot使用 线性拟合回归,lm,我们目前绝对无法handle非线性的回归这些经典分析必须搭配显著性测试,必须在图里显示P-value,或者P-value对应的符号(*、**、***、NS)。目前在ggplot里添加显著...
p.signif: 显著性水平 方法: 用于比较组别的统计检验 创建一个带p值的箱线图: p <- ggboxplot(ToothGrowth, x="supp", y = "len", color = "supp", palette = "jco", add = "jitter") # 添加p值 p + stat_compare_means() # 改变方法 ...
#多组两两比较 ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length)) + geom_boxplot() + geom_signif(comparisons = list(c("versicolor", "virginica"), c("setosa", "virginica"), c("versicolor", "setosa"))) #虽然添加了p值,但参数有重叠 ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length...
e+geom_boxplot() 1. 添加有缺口的箱线图 e+geom_boxplot(notch = TRUE) 1. 按dose分组映射给颜色 e+geom_boxplot(aes(color=dose)) 1. 将dose映射给填充颜色 e+geom_boxplot(aes(fill=dose)) 1. 按supp进行分类并映射给填充颜色 ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len))+ geom_boxplot(aes(...
但是我最近创建了一个ggplot-extension,它简化了添加重要性栏的整个过程:ggsignif不必单调地将geom_line和添加geom_text到绘图中,而只需添加一个图层geom_signif:library(ggplot2)library(ggsignif)ggplot(iris, aes(x=Species, y=Sepal.Length)) + geom_boxplot() + geom_signif(comparisons...
blank(),plot.title=element_text(size=14,face="bold") )画百分比的饼图 require(scales)p + scale_fill_brewer("Blues") + blank_theme + geom_text(aes(y = value/3 + c(0, cumsum(value)[-length(value)]), label = percent(value/100)), size=5)