color="molecular_group", add="jitter", legend="none") + rotate_x_text(angle = 45) + geom_hline(yintercept = mean(myeloma$DEPDC1), linetype=2) + # 添加base mean的水平线 stat_compare_means(method = "anova", label.y = 1600)+ # Add global annova p-value stat_compare_means(label...
AI代码解释 stat.test2<-ToothGrowth%>%mutate(dose=as.factor(dose))%>%group_by(dose)%>%t_test(len~supp)%>%adjust_pvalue()%>%add_significance("p.adj")%>%add_xy_position(x="dose")stat.test3<-ToothGrowth%>%t_test(len~dose,p.adjust.method="bonferroni")%>%adjust_pvalue()%>%add_s...
stat_compare_means(label.y = 50, label.x = 1.5) # Add global p-value还可以设定一个ref group来显示显著性差异,只需要改一下设定。1 2 3 stat_compare_means(method = "anova", label.y = 1.3, label.x = 3)+ # Add pairwise comparisons p-value # # Add global p-value stat_compare_mea...
add_xy_position用于确定添加p值的位置,也可以用add_y_position()代替 scale_y_continuous 用于扩展Y坐标。下面代码中,0.5 意味着向上扩增50%高度。 state_pvalue_mannual 中,可以设置label为 stat.test中的某个列名,比如p或者 p.adj,也可以进行组合:{o.adj}{p.adj.signif} bxp <- ggboxplot( df,x="do...
ggsave("poneway.tiff",plot=poneway,width=7,height=5,units="in", dpi=700) ggpubr包中的stat_pvalue_manual函数用于手动向ggplot添加p值,尤其是添加校正p值,y.position用于设置标签的位置。rstatix包中的tukey_hsd()函数用于事后两两比较检验。
Add the p-values to the plot using the functionstat_pvalue_manual()[in ggpubr package]. The following key options are illustrated in some of the examples: The optionbracket.nudge.yis used to move up or to move down the brackets. ...
(optional) column containing the position of the right sides of the brackets. Default value is "group2". If NULL, the p-values are plotted as a simple text. x x position of the p-value. Should be used only when you want plot the p-value as text (without brackets). ...
Auto-compute p-value label positions using the function add_xy_position() [in rstatix package]. Add the p-values to the plot using the function stat_pvalue_manual() [in ggpubr package]. The following key options are illustrated in some of the examples: The option bracket.nud...
完全使用tidyverse体系进行数据清洗及可视化，使用add_pvalue,stat_pvalue_manual两个函数来自定义添加p值...
GraphPad Prism 9 已经支持自动添加P值了,因此ggprism也增加了add_pvalue函数,添加P值和显著性标记。 这个函数其实是对stat_pvalue_manual函数的重写,stat_pvalue_manual又是基于ggsignif包写的,所以掌握了ggsignif,你就掌握了R语言添加显著性标记的技能。 基本使用 需要提供一个数据框,至少需要4列: xmin:左侧位...