首先读入数据,包含表达值和分组: setwd("E:/生物信息学/ggplot坐标轴截断") A <- read.csv("Exp.csv", header = T) library(ggplot2) library(forcats) library(ggpubr) A$GeneSymbol <- as.factor(A$GeneSymbol) A$GeneSymbol <- fct_inorder(A$GeneSymbol) 计算四分位数: B <- A %>% group...
首先,读取包含表达值和分组的数据集。接下来,计算四分位数并设置需要比较的分组。使用ggplot2进行绘图,展示数据的分布情况,如上图所示。在坐标轴截断方面,展示了两种方法:一种是手动设置轴的显示范围,另一种是使用ggbreak包进行自动截断处理。完成图表制作后,可以使用循环来批量生成图表,以节省操作...
首先读入数据,包含表达值和分组: setwd("E:/生物信息学/ggplot坐标轴截断")A<-read.csv("Exp.csv",header=T)library(ggplot2)library(forcats)library(ggpubr)A$GeneSymbol<-as.factor(A$GeneSymbol)A$GeneSymbol<-fct_inorder(A$GeneSymbol) 计算四分位数: B<-A%>% group_by(GeneSymbol) %>% mutat...
ggplot作图: p<-ggplot(A,aes(GeneSymbol,S100A12,shape=GeneSymbol,fill=GeneSymbol))+geom_jitter(size=3,position=position_jitter(0.2))+scale_shape_manual(values=c(21,24,25,22))+scale_fill_manual(values=c("grey","#0073B5","#C9543B","#E59F3F"))+geom_errorbar(data=B,aes(ymin=lower,...