上一篇文章介绍了corrplot包绘制相关性图,可从心有灵犀:corrplot包绘制相关性图(R语言)这里访问。 这次介绍的是ggcorrplot2包,实现了跟corrplot包相似的功能,且是基于ggplot2语法的,方便拓展。 ggcorrplot2主要有2个函数ggcorrplot和ggcorrplot.mixed。ggcorrplot函数是只能绘制一种图案;ggcorrplot.mixed函数上下部分分别...
在探讨数据可视化与统计分析时，常常需要直观地展示变量间的相关性，而R语言的ggcorrplot2包为我们提供了一种基于ggplot2语法的高效方式来实现这一目标。ggcorrplot2包不仅实现了与corrplot包相似的功能，而且更注重于提供更为灵活和易于扩展的图形界面。ggcorrplot2包中包含两个主要的函数：ggcorrplot和ggcor...
Genomic insights into local adaptation and future climate-induced vulnerability of a keystone forest tree in East Asia 论文中提供的代码链接 https://github.com/jingwanglab/Populus_genomic_prediction_climate_vulnerability/blob/main/4-Local_adaptation/3cor_plot.R https://www.nature.com/articles/s41467...
Genomic insights into local adaptation and future climate-induced vulnerability of a keystone forest tree in East Asia 论文中提供的代码链接 https://github.com/jingwanglab/Populus_genomic_prediction_climate_vulnerability/blob/main/4-Local_adaptation/3cor_plot.R https://www.nature.com/articles/s41467...
ggcorrplot 是一个用于在 R 语言中可视化相关性矩阵的非常有用的包。以下是使用 ggcorrplot 进行相关性分析的步骤,以及如何使用它绘制相关性热图的详细说明: 1. 了解 ggcorrplot 包和相关性分析的基本概念 相关性分析:是一种统计分析方法,用于衡量两个或多个变量之间的关系强度和方向。在 R 中,通常使用 cor() ...
ggcorrplot是一个用于绘制相关矩阵图的R包。它可以用于可视化数据集中变量之间的相关性,并提供了多种选项来自定义图形的外观和布局。 相关图是一种用于显示变量之间相关性的图形。对角线方向通常用于显示变量本身的分布或其他有关变量的信息。使用ggcorrplot包,可以更改相关图的对角线方向,以显示其他有用的信息。
taoyan:伪码农,R语言爱好者,爱开源。 个人博客: / 往期回顾 R语言学习笔记之聚类分析 R语言可视化学习笔记之ggpubr包 R语言可视化学习笔记之添加p-value和显著性标记 基于ggplot2包以及corrplot包的相关矩阵可视化包ggcorrplot,ggcorrplot包提供对相关矩阵重排序以及在相关图中展示显著性水平的方法,同时也能计算相关性...
常用做相关性热图的R包有很多,像corrplot、PerformanceAnalytics等 本次主要介绍一款用ggplot2来做相关性可视化热图的包:ggcorrplot 安装: install.packages("ggcorrplot") 帮助说明: ggcorrplot(corr, method = c("square", "circle"), type = c("full", ...
myggcorrplot <- function (corr, method = c("square", "circle"), type = c("full", "lower", "upper"), ggtheme = ggplot2::theme_minimal, title = "", show.legend = TRUE, legend.title = "Corr", show.diag = FALSE, colors = c("blue", "white", "red"), outline.color =...
公众号“小明的数据分析笔记本”成为了研究者的交流平台，主要分享R语言与Python在数据分析和可视化领域的基础应用实例，以及园艺植物相关基因组学、转录组学与群体遗传学领域的深入研究进展。此外，公众号还提供生物信息学入门学习资料和学习心得，旨在培养和提升用户的数据分析技能。通过这些资源和分享，研究者...