首先,你需要从GitHub上下载gffread的源代码: bash git clone https://github.com/gpertea/gffread.git 2.2 进入源代码目录 下载完成后,进入gffread的源代码目录: bash cd gffread 2.3 编译安装 在源代码目录中,执行以下命令进行编译和安装: bash make release 这条命令会编译gffread,并生成可执行文件。编译完成...
01、下载安装包 下载地址:https://github.com/gpertea/gffread 02、解压、调用测试 [root@PC1 software]# ls gffread-0.12.7.Linux_x86_64.tar.gz [root@PC1 software]# tar-xzvf gffread-0.12.7.Linux_x86_64.tar.gz &> /dev/null## 解压[root@PC1 software]# ls gffread-0.12.7.Linux_x86_64 ...
一、安装 cd～/biosoft gitclonehttps://github.com/gpertea/gffreadcdgffread make release 二、测试 ~/biosoft/gffread/gffread -h 三、使用 使用gffread从gtf文件中提取对应的序列信息 gffread Tissues.A.stringtie.gtf -g ~/Cbp.LG.fasta -w A.transcripts.1.fa...