GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)web工具于2017年首次发布,基于TCGA和GTEx数据库中的肿瘤和正常样本进行基因表达分析。它提供差异表达分析、轮廓绘制、相关性分析、患者生存分析、相似基因检测和PCA分析。http://gepia.cancer-pku.cn/。 1.基因表达的一般...
1.GEPIA2 GEPIA服务器已经运行了两年,为来自42个国家的约11万名用户处理了约28万份分析请求。GEPIA2是GEPIA的更新版本,用于分析来自TCGA和GTEx项目的9736个肿瘤和8587个正常样本的==RNA测序表达数据==。 GEPIA2保留了GEPIA的所有功能,除此之外,GEPIA2还增加了新的数据集和功能。 重点增加的功能增加了基因亚型的分...
1.2 数据库介绍 1.2.1 作用 数据库是用来存放数据的仓库 数据库中存放的是表,表中存放的是数据。 1.2.2 数据库的发展史 萌芽阶段:文件系统 最初始的数据库是用磁盘来存储数据的。文件就是最早的数据库。 第一代数据库:层次模型 优点:这是导航结构 优点:结构清晰,分类查询方便 缺点:有可能造成数据无效 第一...
eggNOG数据库全称是:直系同源蛋白分组比对(evolutionarygenealogy ofgenes:Non-supervisedOrthologousGroups)数据库,由EMBL创建维护,是对NCBI的COG数据库进行拓展,提供不同分类水平蛋白的直系同源分组(Orthologous Groups,OG),包括真核、原核及病毒的数据信息。它扩展了COG数据库的分类方法,采用无监督聚类算法在全基因组范围...
GEPIA服务器已经运行了两年,为来自42个国家的约11万名用户处理了约28万份分析请求。GEPIA2是GEPIA的更新版本,用于分析来自TCGA和GTEx项目的9736个肿瘤和8587个正常样本的==RNA测序表达数据==。 GEPIA2保留了GEPIA的所有功能,除此之外,GEPIA2还增加了新的数据集和功能。
常见数据库介绍,Cache数据库 Cache数据库,法国Intersystems公司产品,目前主要应用于医疗卫生管理信息系统(HIS)。官方数据显示,数据查询速度约为oracle的7~20倍,并方便的支持关系型数据库和对象型数据库。 后关系型数据库(PostRelationalda
数据库下载地址:http://www.cbsr.ia.ac.cn/users/xiangyuzhu/projects/3DDFA/main.htm 发现目前没有介绍AFLW2000数据库的博客。记录一下, 随便找了一个mat文件,读取了一下,内容如下所示,是一个dict,pt2d指的是2维平面21个特征点的坐标,他们的shape我都打印了出来。