geom_tile参数 geom_tile是ggplot2包中的一个函数,用于创建矩形瓦片图。它通常用于可视化二维数据集,其中矩形的颜色编码表示数据的值。这个函数可以接受一系列参数来定制矩形瓦片图的外观和行为。 其中一些常用的参数包括: data,指定要用于绘图的数据集。 mapping,用于指定x和y轴变量以及颜色变量的映射关系。 aes,用于...
其中,geom_tile函数可以用来创建热图,但也可以用来创建与热图完全不同的图形。 geom_tile函数可以将数据映射到矩形的颜色和大小上,从而创建出热图。但是,如果我们改变了数据的映射方式,就可以得到与热图完全不同的图形效果。 例如,我们可以将数据映射到矩形的位置上,从而创建出一个类似散点图的效果。具体实...
ggplot2是R语言中一种常用的数据可视化包,而geom_tile是ggplot2中的一种几何对象,用于创建瓦片图。瓦片图是一种二维图形,通过不同颜色或填充来表示数据的值。 使用ggplot2的geom_tile函数可以控制瓦片的半径,具体来说,可以通过调整瓦片的宽度和高度来改变瓦片的半径大小。通过设置不同的宽度和高度,可以创建不同大小...
(2)直接修改ylim()函数 注意在ggplot2里,就有ylim()这个函数,用以修改坐标轴域。与上面不一样的是此函数约定当变量y轴值抽过给定范围时,则不绘制该数据。 ggplot(diamonds,aes(x=y))+geom_histogram(binwidth=0.5)+ylim(0,50)#此时 warning也有提示删除了超限的值 ylim(0, 50) 异常值一般会干扰整体的分...
图层函数 说明 geom_blank blank geom_point 散点图 geom_dotplot 堆叠的点图 geom_line 线形图 geom_step 阶梯图 geom_abline 直线 geom_hline 水平线 geom_vline 垂直线 geom_area 线与x轴围成的区域 geom_path 点组成的路线图 geom_rect 绘制矩形 geom_raster 绘制矩形 geom_tile 绘制矩形 geom_polygo...
给定geom_tile()的位置坐标(x和y)以及维度(width和height) 给定geom_rect()y的上(ymax)和下(ymin)边界,x的左(xmin)和右(xmax)边界 给定geom_polygon()每个角的四行带有x和y位置的数据框 其它相关的几何对象有: geom_segment()和geom_line()
使用geom_violin函数即可。 ggplot(data = heightweight, aes(x = sex, y = heightIn)) + geom_violin() 示例数据绘图 小提琴图也是核密度估计,取核密度曲线的镜像使形状对称。弥补了密度图进行多组绘图时的彼此干扰的问题。 传统绘图会在小提琴图中间叠加一个箱线图,并显示中位数为白圈。
ggplot(faithfuld, aes(waiting, eruptions, fill = density)) + geom_tile() + scale_fill_gradient(low = "blue", high = "red") + guides(fill = guide_colorbar(title = "密度", barwidth = 20)) 11、annotation() 函数用于在图表中添加注释(annotation)元素,例如文本、箭头、线条等 ...
R中有很多可以制作热力图的包和软件,如R本身提供的heatmap()函数,ggplot2中的geom_tile(),lattice中的levelplot(),pheatmap、ggcor、ComplexHeastmap等 image #BiocManager::install("ComplexHeatmap")library(ComplexHeatmap)test=matrix(rnorm(200),20,10)test[1:10,seq(1,10,2)]=test[1:10,seq(1,10,2...
melt数据,处理成ggplot2能够直接处理的数据结构,并加上列名 ggplot_tile进行画图 gplots 数据处理成矩阵形式,给行名列名 调制颜色并用heatmap.2画热图(heatmap.2函数内部用hclustfun 进行聚类) R语言代码 library(pheatmap)library(data.table)CN_DT<- fread("/home/ywliao/project/Gengyan/ONCOCNV_result/ONCO...